RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR4F17Q8NGA8 305 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR52B6Q8NGF0 335 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR1K1Q8NGR3 316 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR4F5Q8NH21 305 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR1F12Q8NHA8 337 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPX8Q8TED1 209 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SCARB1Q8WTV0 552 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TM9SF4Q92544 642 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DYRK2Q92630 601 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NUS1Q96E22 293 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IL17FQ96PD4 163 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC38A2Q96QD8 506 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR4F4Q96R69 305 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PANX1Q96RD7 426 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TESK2Q96S53 571 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC6A7Q99884 636 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KCNS3Q9BQ31 491 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPR174Q9BXC1 333 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PARD6BQ9BYG5 372 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RAB34Q9BZG1 259 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IL22Q9GZX6 179 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VCPKMTQ9H867 229 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PXMP2Q9NR77 195 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SMOXQ9NWM0 555 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KCNG2Q9UJ96 466 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANAPC7Q9UJX3 599 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OARD1Q9Y530 152 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AUP1Q9Y679 476 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SMCHD1A6NHR9 2005 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FRMPD4Q14CM0 1322 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STK36Q9NRP7 1315 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RAB19A4D1S5 217 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRABD2BA6NFA1 517 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CD8B2A6NJW9 211 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C12orf71A8MTZ7 269 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 K7ERQ8 282 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IMPA2O14732 288 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CLOCKO15516 846 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TNFSF12O43508 249 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TOM1O60784 492 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UPK3AO75631 287 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR2J3O76001 311 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRT36O76013 467 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IVLP07476 585 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CELA2AP08217 269 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MYL2P10916 166 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ABOP16442 354 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AOC1P19801 751 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SERPINA2P20848 420 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC2A5P22732 501 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SAA4P35542 130 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HSD17B2P37059 387 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CRYBB2P43320 205 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CDKN1BP46527 198 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CASP4P49662 377 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STK19P49842 368 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HADHBP55084 474 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAP3K7CLP57077 242 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RAB11AP62491 216 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DPTQ07507 201 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TEAD2Q15562 447 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TWIST1Q15672 202 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TAB1Q15750 504 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RAB11BQ15907 218 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM16LQ309B1 348 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UNC50Q53HI1 259 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BEX5Q5H9J7 111 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TECRLQ5HYJ1 363 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LGSNQ5TDP6 509 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C9orf135Q5VTT2 229 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms