RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354848.5

CD46-203, Transcript of CD46 molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD46, Length 3,233 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46-203ENST00000354848 ORAI1Q96D31 301 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 OR1F2PQ96R84 312 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TINF2Q9BSI4 451 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 IL26Q9NPH9 171 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 NIT2Q9NQR4 276 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 KLHL1Q9NR64 748 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 UTRNP46939 3433 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 OR6C68A6NDL8 312 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 C5orf58C9J3I9 102 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SEPT4O43236 478 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 B3GAT3O94766 335 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 MMP3P08254 477 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ACP5P13686 325 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TBXA2RP21731 343 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 CCR7P32248 378 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 HNF1BP35680 557 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 FNTBP49356 437 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 KCNA10Q16322 511 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 CCDC157Q569K6 752 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TPRA1Q86W33 373 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 VOPP1Q96AW1 172 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ARL5BQ96KC2 179 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 NOX3Q9HBY0 568 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SGK2Q9HBY8 427 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 A0A1W2PRQ8 180 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 OR2W5A6NFC9 320 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 UGDHO60701 494 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 UBXN7O94888 489 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 CH25HO95992 272 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 CRYBA1P05813 215 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 FURINP09958 794 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ATP6V1E1P36543 226 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 H2BFSP57053 126 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 GUCA2BQ16661 112 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SPRYD7Q5W111 196 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SVBPQ8N300 66 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 MORN4Q8NDC4 146 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 THEM6Q8WUY1 208 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ASB11Q8WXH4 323 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 RFKQ969G6 155 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SLC25A28Q96A46 364 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TMEM19Q96HH6 336 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ORAI3Q9BRQ5 295 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 BRF2Q9HAW0 419 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 RASL12Q9NYN1 266 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 RAB19A4D1S5 217 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 F5H5T6 163 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SULT1C2O00338 296 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 CTDSPLO15194 276 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ADAM12O43184 909 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ITGA10O75578 1167 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 C8GP07360 202 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 HSD3B2P26439 372 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 BDH1Q02338 343 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 APOOLQ6UXV4 268 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 VRK3Q8IV63 474 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-203ENST00000354848 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms