RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 H0YIV9 168 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 TSPAN4O14817 238 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 SEC14L5O43304 696 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 TFAP2AP05549 437 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 CRABP1P29762 137 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 UEVLDQ8IX04 471 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 OR5D16Q8NGK9 328 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 OR13C3Q8NGS6 347 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 COPZ2Q9P299 210 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRS-201ENST00000262963 A6NCN8 305 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 A8MVJ9 347 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CACNG3O60359 315 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OTX2P32243 289 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 XCR1P46094 333 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TLE3Q04726 772 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 KLHL15Q96M94 604 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ATE1O95260 518 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 DNASE1P24855 282 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ACTBP60709 375 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CXCR4P61073 352 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ACTG1P63261 375 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 RAB11BQ15907 218 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 METTL4Q8N3J2 472 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SYT4Q9H2B2 425 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 POLE4Q9NR33 117 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 MLXQ9UH92 298 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SGK494L7N484 410 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FRS3O43559 492 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 GPR75O95800 540 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 HRGP04196 525 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 THBS2P35442 1172 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CXCL12P48061 93 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 YPEL5P62699 121 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 BTBD16Q32M84 506 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FRMPD2BQ6IN97 320 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SYT14Q8NB59 555 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ALG8Q9BVK2 526 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 POT1Q9NUX5 634 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ERVK-19Q9WJR5 959 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SHROOM3Q8TF72 1996 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ACOT7O00154 380 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FOSL2P15408 326 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 AMY2BP19961 511 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 LHCGRP22888 699 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 EFR3AQ14156 821 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CDNFQ49AH0 187 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OR5J2Q8NH18 312 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF583Q96ND8 569 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CD93Q9NPY3 652 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ABCG2Q9UNQ0 655 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 A6NIZ1 184 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 BRINP1O60477 761 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 MAS1P04201 325 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 POU3F4P49335 361 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 RAP1BP61224 184 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 RAP1AP62834 184 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ACVR1Q04771 509 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms