RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NrrosQ8BMT4 693 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rdh1Q8CGV4 317 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cacna1dQ99246 2179 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm16434J3QN10 205 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4930555G01RikL7N253 205 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Drd4P51436 387 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fut10Q5F2L2 481 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scgb2b2Q6UGQ3 114 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1275Q7TQY8 312 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bend7Q8BSV3 434 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ncr1Q8C567 325 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cnppd1Q8K158 407 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rpe65Q91ZQ5 533 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lactb2Q99KR3 288 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atg12Q9CQY1 141 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Asb3Q9WV72 525 aa15.97■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1511E9PWU0 318 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1510E9PZZ6 318 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r88E9Q235 316 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Maml2F6U238 1170 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TpoP35419 914 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cxcr4P70658 359 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1161Q7TR29 321 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr290Q7TS13 315 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MastlQ8C0P0 865 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc22a22Q8R0S9 554 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cys1Q8R4T1 145 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr689Q8VG18 320 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gatad2bQ8VHR5 594 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cela3aA2A9U8 283 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aadacl2B2RWD2 401 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr237-ps1K9J725 310 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r169L7N275 304 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ntrk2P15209 821 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gpx5P21765 221 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc6a11P31650 627 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fv1P70213 459 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ElocP83940 112 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmub2Q3V209 319 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ExogQ8C163 368 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam155aQ8CCS2 467 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Entpd8Q8K0L2 497 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fuca1Q99LJ1 452 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AspdhQ9DCQ2 287 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam136b-psA0A140T8T1 138 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mgl2A9XX86 381 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp605E9QAH2 694 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pcsk6F6XJP7 959 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Opn1mwO35599 359 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AldocP05063 363 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Acta2P62737 377 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Actg2P63268 376 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cnpy1Q4VAB4 94 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tgfbr2Q62312 592 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1463Q7TQR3 310 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plekhn1Q8C886 359 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem268Q8R239 342 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ffar2Q8VCK6 330 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr644Q8VH21 314 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ces2cQ91WG0 561 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NansQ99J77 359 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sapcd1Q9CY86 146 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q9D1Z2 194 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ceacam20Q9D2Z1 577 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc107Q9DCC3 242 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RhagQ9QUT0 438 aa15.96■□□□□ 0.15
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm17949A0A1B0GRV7 212 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm7951E9Q0A2 213 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm6482F6YHC1 213 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm17124F6ZIG1 213 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp619G3X9T2 1161 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wdr20Q3UWE6 569 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Grxcr1Q50H32 290 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PrlhrQ6VMN6 370 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CenpiQ8K1K4 746 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Memo1Q91VH6 297 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spred2Q924S7 410 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MtapQ9CQ65 283 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Phf6Q9D4J7 364 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hm13Q9D8V0 378 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hapln2Q9ESM3 341 aa15.96■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm13285B1AYI3 182 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm13275B1AYI8 182 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd38P56528 304 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cds1P98191 461 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cnn2Q08093 305 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sdc3Q64519 442 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 IfnzQ8BQT1 182 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fem1abQ8C0T1 654 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm13278Q8CD73 182 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf222Q8CEF8 211 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8K039 155 aa15.95■□□□□ 0.14
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc31a1Q8K211 196 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.7 ms