Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWE6

Wdr20, MCG14935, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr20Q3UWE6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Wdr20Q3UWE6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Wdr20Q3UWE6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Wdr20Q3UWE6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Wdr20Q3UWE6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Wdr20Q3UWE6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Wdr20Q3UWE6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Wdr20Q3UWE6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Wdr20Q3UWE6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Wdr20Q3UWE6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Wdr20Q3UWE6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Wdr20Q3UWE6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr20Q3UWE6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr20Q3UWE6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Wdr20Q3UWE6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Wdr20Q3UWE6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Wdr20Q3UWE6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Wdr20Q3UWE6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr20Q3UWE6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr20Q3UWE6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr20Q3UWE6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr20Q3UWE6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr20Q3UWE6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr20Q3UWE6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdr20Q3UWE6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr20Q3UWE6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr20Q3UWE6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr20Q3UWE6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr20Q3UWE6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr20Q3UWE6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr20Q3UWE6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr20Q3UWE6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr20Q3UWE6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdr20Q3UWE6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Wdr20Q3UWE6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Wdr20Q3UWE6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr20Q3UWE6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Wdr20Q3UWE6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Wdr20Q3UWE6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Wdr20Q3UWE6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Wdr20Q3UWE6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Wdr20Q3UWE6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Wdr20Q3UWE6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Wdr20Q3UWE6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Wdr20Q3UWE6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr20Q3UWE6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Wdr20Q3UWE6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr20Q3UWE6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Wdr20Q3UWE6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Wdr20Q3UWE6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Wdr20Q3UWE6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Wdr20Q3UWE6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Wdr20Q3UWE6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr20Q3UWE6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Wdr20Q3UWE6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Wdr20Q3UWE6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Wdr20Q3UWE6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Wdr20Q3UWE6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Wdr20Q3UWE6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Wdr20Q3UWE6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Wdr20Q3UWE6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Wdr20Q3UWE6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Wdr20Q3UWE6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Wdr20Q3UWE6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Wdr20Q3UWE6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Wdr20Q3UWE6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Wdr20Q3UWE6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Wdr20Q3UWE6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Wdr20Q3UWE6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Wdr20Q3UWE6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Wdr20Q3UWE6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Wdr20Q3UWE6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Wdr20Q3UWE6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Wdr20Q3UWE6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Wdr20Q3UWE6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Wdr20Q3UWE6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Wdr20Q3UWE6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Wdr20Q3UWE6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Wdr20Q3UWE6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Wdr20Q3UWE6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Wdr20Q3UWE6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Wdr20Q3UWE6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Wdr20Q3UWE6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Wdr20Q3UWE6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr20Q3UWE6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr20Q3UWE6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr20Q3UWE6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr20Q3UWE6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Wdr20Q3UWE6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Wdr20Q3UWE6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Wdr20Q3UWE6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Wdr20Q3UWE6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Wdr20Q3UWE6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Wdr20Q3UWE6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wdr20Q3UWE6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Wdr20Q3UWE6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Wdr20Q3UWE6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Wdr20Q3UWE6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Wdr20Q3UWE6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdr20Q3UWE6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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