RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPE3	YPR069C	ARK1	P53974	638 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	ESC8	Q08119	714 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	IRA2	P19158	3079 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	NUM1	Q00402	2748 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	RPC53	P25441	422 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	RAD27	P26793	382 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	VID24	P38263	362 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	ERC1	P38767	581 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	THI6	P41835	540 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	BFA1	P47113	574 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	SHE10	P53075	577 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	YML083C	Q04526	418 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	ADY4	Q05955	493 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	CUR1	Q06469	252 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	PLP2	Q12017	286 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	ELG1	Q12050	791 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	PTC5	Q12511	572 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	ZPS1	Q12512	249 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPE3	YPR069C	HMG2	P12684	1045 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PEX1	P24004	1043 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	YKL097C	P34245	136 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	ARP1	P38696	384 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	DAK2	P43550	591 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	YGL081W	P53156	320 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	EEB1	Q02891	456 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	YDR090C	Q03193	310 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	YPL150W	Q12152	901 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	FOB1	O13329	566 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	SPE1	P08432	466 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	YSC83	P32792	385 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	MNN4	P36044	1178 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	YTA12	P40341	825 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	LSB6	P42951	607 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	NUT1	P53114	1132 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	TAM41	P53230	385 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	VTC3	Q02725	835 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	TRS130	Q03660	1102 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	TTI1	P36097	1038 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	RFC5	P38251	354 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	MMS4	P38257	691 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	GUP1	P53154	560 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	SEC5	P89102	971 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PML39	Q03760	334 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	OSH2	Q12451	1283 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PGS1	P25578	521 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	RAM2	P29703	316 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PEX2	P32800	271 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PET10	P36139	283 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	YBR284W	P38150	797 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	HXT5	P38695	592 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	ULI1	P43604	169 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	ENT3	P47160	408 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	UBA2	P52488	636 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PCK1	P10963	549 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PEP7	P32609	515 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	TRM2	P33753	639 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	UBP13	P38187	747 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	ORC5	P50874	479 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	ADA2	Q02336	434 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	YDL057W	Q07379	328 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	REC8	Q12188	680 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	CIT2	P08679	460 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	MAS1	P10507	462 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.66	□□□□□ -1.18	not detected
SPE3	YPR069C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.66	□□□□□ -1.18	not detected
SPE3	YPR069C	STB4	P50104	949 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	SPC98	P53540	846 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	TOF1	P53840	1238 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	STP1	Q00947	519 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	APM4	Q99186	491 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	GAL80	P04387	435 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	HIS5	P07172	385 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	RAM1	P22007	431 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPE3	YPR069C	PRR1	P28708	518 aa		7.65	□□□□□ -1.18

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