RNA–Protein interactions for RNA: YMR250W

GAD1, Transcript of Glutamate decarboxylase, yeast

Gene GAD1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAD1	YMR250W	ATG19	P35193	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	RPC25	P35718	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	ERC1	P38767	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	MXR1	P40029	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	AVT1	P47082	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YAP7	Q08182	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	MRC1	P25588	1096 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	EAF5	P39995	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YJR107W	P47145	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	SEC5	P89102	971 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	RGR1	P19263	1082 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	DAL7	P21826	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
GAD1	YMR250W	BCS1	P32839	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	TIM23	P32897	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YEL1	P34225	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YET1	P35723	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	GPT2	P36148	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	BCD1	P38772	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	HUL4	P40985	892 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	ARK1	P53974	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	VPS72	Q03388	795 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	MAM3	Q12296	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
GAD1	YMR250W	PCK1	P10963	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	MSH3	P25336	1018 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	MCM2	P29469	868 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	PAH1	P32567	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	SKP2	P42843	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	ACF4	P47129	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	MDR1	P53258	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	SUT2	Q12286	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GAD1	YMR250W	PHO8	P11491	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	KIN82	P25341	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	TRK2	P28584	889 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	SEC65	P29478	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	MET22	P32179	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	YSC83	P32792	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	VPS70	P47161	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	VPS62	P53285	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	ULP1	Q02724	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	ROD1	Q02805	837 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	HED1	Q03937	162 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	MLH2	Q07980	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	TCO89	Q08921	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	MED1	Q12321	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	SNA3	P14359	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	UBP13	P38187	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	AFG3	P39925	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	TAM41	P53230	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	RTT102	P53330	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	COQ9	Q05779	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	SPO75	Q07798	868 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	RTP1	Q12751	981 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	KTR2	P33550	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	VPS35	P34110	944 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	SAP190	P36123	1033 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	CTM1	P38818	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	RTT107	P38850	1070 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	SAD1	P43589	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	MSC2	Q03455	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	CUR1	Q06469	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	ERF2	Q06551	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	IES4	Q08561	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	CHS2	P14180	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	COT1	P32798	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	XRS2	P33301	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	VID24	P38263	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	UBP5	P39944	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAD1	YMR250W	OSW7	P43611	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms