RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	BLS1	Q06071	122 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PEX15	Q08215	383 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SAS4	Q04003	481 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TAF11	Q04226	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SGD1	Q06132	899 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ENT1	Q12518	454 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	NUP170	P38181	1502 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RGP1	P16664	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	IRE1	P32361	1115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MDJ1	P35191	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RAD26	P40352	1085 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SKY1	Q03656	742 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	PGC1	Q08959	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	DPH6	Q12429	685 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MMS22	Q06164	1454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	NUP159	P40477	1460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ACE2	P21192	770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	UBS1	P38290	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SHU2	P38957	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RET2	P43621	546 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YNL058C	P53947	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ECM9	Q02202	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ARA2	Q04212	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ATG33	Q06485	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	AOS1	Q06624	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	AAC3	P18238	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	FUN30	P31380	1131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	PAH1	P32567	862 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YIL165C	P40446	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	IRC6	P43615	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YAP1802	P53309	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HAP5	Q02516	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YKU80	Q04437	629 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	PGS1	P25578	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YKU70	P32807	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YGR153W	P48238	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MRPL19	P53875	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ENA1	P13587	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MSH1	P25846	959 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HOG1	P32485	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	NPL6	P32832	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	AIM14	P53109	570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	DFG5	Q05031	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	EST2	Q06163	884 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RSC3	Q06639	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TAH18	Q12181	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MET8	P15807	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SEG2	P34250	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MCM7	P38132	845 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MPH1	P40562	993 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TEP1	P53916	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HIM1	Q06674	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	BI4	P03879	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MCD4	P36051	919 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	EXO5	P38289	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	JEM1	P40358	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	GUP2	Q08929	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HMG1	P12683	1054 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HOP1	P20050	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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