RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 TAF5LO75529 589 aa9□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 VPS37DQ86XT2 251 aa9□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 SSH3Q8TE77 659 aa9□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 RXRAP19793 462 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 A0A0D9SFI3 127 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 STARD3NLO95772 234 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 AGLP35573 1532 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 SASH1O94885 1247 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ATP6V1AP38606 617 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 USP31Q70CQ4 1352 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 PTCH1Q13635 1447 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 RNF20Q5VTR2 975 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 DRC7Q8IY82 874 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 BICD2Q8TD16 824 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 BRF1Q92994 677 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 SHPRHQ149N8 1683 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 GJB2P29033 226 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 RAD21O60216 631 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ADCY9O60503 1353 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 NBPF26B4DH59 902 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 CPLX1O14810 134 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ALDH1L1O75891 902 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 DDB1Q16531 1140 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 NBPF14Q5TI25 921 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 NBPF15Q8N660 670 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 EVI5LQ96CN4 794 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.96□□□□□ -0.97
PKP4-217ENST00000628904 DIP2AQ14689 1571 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 MED14O60244 1454 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 A0A1B0GUL7 405 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 SGSM2O43147 1006 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 LARGE1O95461 756 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 ADORA1P30542 326 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 HLFQ16534 295 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 PIGBQ92521 554 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 TNNI3KQ59H18 835 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 VPS53Q5VIR6 699 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 SPC24Q8NBT2 197 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 KCNQ2O43526 872 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 SNX21Q969T3 373 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 IFT172Q9UG01 1749 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 TECPR2O15040 1411 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 ATP10DQ9P241 1426 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 MINDY4BA8MYZ0 360 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 KDRP35968 1356 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 175.5 ms