RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627383.2

FHL1-222, Transcript of four and a half LIM domains 1, human

TSL 4

Gene FHL1, Length 566 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FHL1-222	ENST00000627383	CHL1	O00533	1208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	PRELP	P51888	382 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	HOXB7	P09629	217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	PDIA6	Q15084	440 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	NTSR2	O95665	410 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	LAMB2	P55268	1798 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	ANXA1	P04083	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	GNAI1	P63096	354 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	PSMD1	Q99460	953 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	APAF1	O14727	1248 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.14	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	POTEC	B2RU33	542 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	TAF1	P21675	1872 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	BBOX1	O75936	387 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	FZD9	O00144	591 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	GPC2	Q8N158	579 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	ABCC4	O15439	1325 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	ANP32C	O43423	234 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FHL1-222	ENST00000627383	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms