RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 MYL6BP14649 208 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 GPTP24298 496 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 FAM161AQ3B820 660 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 PSMD1Q99460 953 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 NYXQ9GZU5 481 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 TAF1P21675 1872 aa17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 VEGFBP49765 207 aa17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 ZBTB3Q9H5J0 574 aa17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-220ENST00000597474 NFE2L2Q16236 605 aa17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 SUSD4Q5VX71 490 aa17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 C3orf67Q6ZVT6 689 aa17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 GPC2Q8N158 579 aa17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 NTSR2O95665 410 aa17.19■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 NEFMP07197 916 aa17.18■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF34Q8IZ26 560 aa17.18■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 CNTROBQ8N137 903 aa17.18■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 JDP2Q8WYK2 163 aa17.18■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.18■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa17.17■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 LRP10Q7Z4F1 713 aa17.17■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 THSD7BQ9C0I4 1608 aa17.17■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 RASSF10A6NK89 507 aa17.16■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 SCNN1DP51172 638 aa17.16■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 CRAMP1Q96RY5 1269 aa17.16■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 EIF6P56537 245 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 LARGE2Q8N3Y3 721 aa17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 WBP1LQ9NX94 342 aa17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 ERBB4Q15303 1308 aa17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-220ENST00000597474 EPS15P42566 896 aa17.14■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 PDIA6Q15084 440 aa17.14■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 PROSER3Q2NL68 480 aa17.14■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.14■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 ANXA1P04083 346 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 DEFB115Q30KQ5 88 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 AIDAQ96BJ3 306 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 LBX1P52954 281 aa17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 LRRC37AA6NMS7 1700 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 PPIP5K2O43314 1243 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 AOC3Q16853 763 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 PARP10Q53GL7 1025 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 NIM1KQ8IY84 436 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 ABCC4O15439 1325 aa17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 SLC10A5Q5PT55 438 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 NLRP3Q96P20 1036 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 DUOX1Q9NRD9 1551 aa17.1■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 TRAF5O00463 557 aa17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 NECTIN2Q92692 538 aa17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
FCHO1-220ENST00000597474 RIPK4P57078 832 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 CST9Q5W186 159 aa17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 CXCL9Q07325 125 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 NLRP10Q86W26 655 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 CAPNS2Q96L46 248 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 COL4A1P02462 1669 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 KRT24Q2M2I5 525 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 CYP4F22Q6NT55 531 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 COPS6Q7L5N1 327 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF428Q96B54 188 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 VPS33BQ9H267 617 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 BABAM1Q9NWV8 329 aa17.05■□□□□ 0.32
FCHO1-220ENST00000597474 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms