RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 ATF3P18847 181 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 GIMAP6Q6P9H5 292 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 BOLA2Q9H3K6 86 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 GJB2P29033 226 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ADCY9O60503 1353 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 TTC14Q96N46 770 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 STK3Q13188 491 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 TAF6LQ9Y6J9 622 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ECHDC1Q9NTX5 307 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 CHGBP05060 677 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 SUCLG2Q96I99 432 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 HYPKQ9NX55 129 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 F13A1P00488 732 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 PRIMPOLQ96LW4 560 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 AOX1Q06278 1338 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 LTN1O94822 1766 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ME3Q16798 604 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 TCHHQ07283 1943 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 NFAT5O94916 1531 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 KIF1AQ12756 1690 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 PPFIA3O75145 1194 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 CAMK4Q16566 473 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 PDCL2Q8N4E4 241 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 SASH1O94885 1247 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 34.1
FCHO1-216ENST00000596536 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 FSD1Q9BTV5 496 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 STRN4Q9NRL3 753 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 KIF3AQ9Y496 699 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ADCY5O95622 1261 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 GCP02774 474 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 KSR2Q6VAB6 950 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 KAT6BQ8WYB5 2073 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 A0A0D9SFI3 127 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 PHF14O94880 888 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 FOSBP53539 338 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 ST3GAL1Q11201 340 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC183Q5T5S1 534 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 RUFY2Q8WXA3 655 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 KAZALD1Q96I82 304 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 SPC24Q8NBT2 197 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 GPATCH3Q96I76 525 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 BABAM1Q9NWV8 329 aa12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
FCHO1-216ENST00000596536 GRM8O00222 908 aa12.71□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 CREB3L3Q68CJ9 461 aa12.71□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 MTMR6Q9Y217 621 aa12.71□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.7□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 TTC41PQ6P2S7 1318 aa12.7□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC171Q6TFL3 1326 aa12.7□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 UBE2HP62256 183 aa12.7□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 PXDNQ92626 1479 aa12.7□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.69□□□□□ -0.38
FCHO1-216ENST00000596536 CDC37L1Q7L3B6 337 aa12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms