RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 KLRG1Q96E93 195 aa23.91■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 SCN4AP35499 1836 aa23.91■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 PSMD1Q99460 953 aa23.9■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.89■■□□□ 1.42
CTIF-206ENST00000588345 KRT24Q2M2I5 525 aa23.89■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.89■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 COPS6Q7L5N1 327 aa23.89■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.89■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 HOXB7P09629 217 aa23.88■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.88■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 SYNE4Q8N205 404 aa23.88■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.87■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 JMYQ8N9B5 988 aa23.87■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.87■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 NECTIN2Q92692 538 aa23.87■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.86■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 FZD9O00144 591 aa23.86■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.86■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 CFAP44Q96MT7 982 aa23.86■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 NLRP3Q96P20 1036 aa23.86■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.85■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 LAMB2P55268 1798 aa23.84■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 TCIRG1Q13488 830 aa23.84■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 CHADLQ6NUI6 762 aa23.84■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 NLRP10Q86W26 655 aa23.84■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 POTEIP0CG38 1075 aa23.83■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 POTEJP0CG39 1038 aa23.83■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.83■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.83■■□□□ 1.41
CTIF-206ENST00000588345 ZNF853P0CG23 659 aa23.82■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 COL4A5P29400 1685 aa23.82■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 IFFO2Q5TF58 517 aa23.81■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 LDHDQ86WU2 507 aa23.8■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 JDP2Q8WYK2 163 aa23.8■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 MBIPQ9NS73 344 aa23.8■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.8■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 SLC51AQ86UW1 340 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 GPC2Q8N158 579 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 HACL1Q9UJ83 578 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 ABCC4O15439 1325 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 APAF1O14727 1248 aa23.78■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.78■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 IFT57Q9NWB7 429 aa23.78■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.77■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 HYPKQ9NX55 129 aa23.77■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CTIF-206ENST00000588345 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.76■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.76■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 VPS33BQ9H267 617 aa23.76■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 PASKQ96RG2 1323 aa23.76■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 BBOX1O75936 387 aa23.75■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 EPHX2P34913 555 aa23.75■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 GNAI1P63096 354 aa23.75■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 CREBZFQ9NS37 354 aa23.75■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 SP8Q8IXZ3 490 aa23.74■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 GRAPQ13588 217 aa23.72■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.72■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 LTBP1Q14766 1721 aa23.72■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 PPIP5K2O43314 1243 aa23.71■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 NIM1KQ8IY84 436 aa23.71■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 TAF1P21675 1872 aa23.7■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.7■■□□□ 1.39
CTIF-206ENST00000588345 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.7■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.69■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 SCNN1DP51172 638 aa23.69■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 AOC3Q16853 763 aa23.69■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 TMC4Q7Z404 712 aa23.69■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 MPNDQ8N594 471 aa23.68■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 FAM89AQ96GI7 184 aa23.68■■□□□ 1.38
CTIF-206ENST00000588345 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.68■■□□□ 1.38
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