RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 WWC1Q8IX03 1113 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 MIER1Q8N108 512 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 CFAP44Q96MT7 982 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 NYXQ9GZU5 481 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ZBTB22O15209 634 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ANXA1P04083 346 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 GPTP24298 496 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 KRT24Q2M2I5 525 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 PROSER3Q2NL68 480 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 NECTIN2Q92692 538 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 IFT57Q9NWB7 429 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 LAMB2P55268 1798 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCC12Q96J65 1359 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXB7P09629 217 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 HSPA6P17066 643 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ERFEQ4G0M1 354 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 SOGA3Q5TF21 947 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 SUSD4Q5VX71 490 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR63Q8IWG1 891 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 RRAGCQ9HB90 399 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 CEP350Q5VT06 3117 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 GLTPD2A6NH11 291 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 NTSR2O95665 410 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 ALDH1B1P30837 517 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 CRY2Q49AN0 593 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 PARP10Q53GL7 1025 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 COPS6Q7L5N1 327 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR90Q96KV7 1748 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 TAF1P21675 1872 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC93Q567U6 631 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 MBIPQ9NS73 344 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-210ENST00000588340 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 GNAI1P63096 354 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 TCIRG1Q13488 830 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 OLFM4Q6UX06 510 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 SCN4AP35499 1836 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 POTECB2RU33 542 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 FSTL1Q12841 308 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 NLRP10Q86W26 655 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 OTUD5Q96G74 571 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 NLRP3Q96P20 1036 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 HYPKQ9NX55 129 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 CACNA1FO60840 1977 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 SNED1Q8TER0 1413 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 APLP1P51693 650 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 SYNE4Q8N205 404 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 PSMD1Q99460 953 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-210ENST00000588340 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms