RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.59□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 CACNA1GO43497 2377 aa10.59□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 HOXC9P31274 260 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 TESK2Q96S53 571 aa10.58□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.57□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 MUC6Q6W4X9 2439 aa10.57□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 SNED1Q8TER0 1413 aa10.57□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF10AO00220 468 aa10.56□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 SOGA3Q5TF21 947 aa10.56□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 GUCD1Q96NT3 240 aa10.56□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 CDH23Q9H251 3354 aa10.56□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 RPTORQ8N122 1335 aa10.56□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 FKTNO75072 461 aa10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 FBLN1P23142 703 aa10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 CCDC93Q567U6 631 aa10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 POLR3GLQ9BT43 218 aa10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 BRIP1Q9BX63 1249 aa10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.55□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 NCOR1O75376 2440 aa10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 TJP1Q07157 1748 aa10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 CNKSR1Q969H4 720 aa10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 ZNF333Q96JL9 665 aa10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 GPRC5DQ9NZD1 345 aa10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 TRIM17Q9Y577 477 aa10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.54□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 SRGNP10124 158 aa10.53□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 CAP1Q01518 475 aa10.53□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 STYK1Q6J9G0 422 aa10.53□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 CDC37L1Q7L3B6 337 aa10.53□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 USP48Q86UV5 1035 aa10.53□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 DPF3Q92784 378 aa10.53□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.53□□□□□ -0.72
GGA3-218ENST00000584243 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 ZPR1O75312 459 aa10.52□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 PDE6BP35913 854 aa10.52□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 PRR5LQ6MZQ0 368 aa10.52□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 STAP2Q9UGK3 403 aa10.52□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 MRC1P22897 1456 aa10.52□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 TRPM4Q8TD43 1214 aa10.51□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.51□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 NARFQ9UHQ1 456 aa10.51□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.51□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 CCDC184Q52MB2 194 aa10.5□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 SHISA4Q96DD7 197 aa10.5□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.49□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.49□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.49□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 PANK3Q9H999 370 aa10.49□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 SHTN1A0MZ66 631 aa10.48□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 LRIT3Q3SXY7 679 aa10.48□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.48□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 MASTLQ96GX5 879 aa10.48□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 ZNF609O15014 1411 aa10.48□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 ZFHX4Q86UP3 3567 aa10.47□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 TM4SF4P48230 202 aa10.47□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 JDP2Q8WYK2 163 aa10.47□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 ADM5C9JUS6 153 aa10.46□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 BCAMP50895 628 aa10.46□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 SLC51AQ86UW1 340 aa10.46□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.46□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.46□□□□□ -0.73
GGA3-218ENST00000584243 COL15A1P39059 1388 aa10.45□□□□□ -0.74
GGA3-218ENST00000584243 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
GGA3-218ENST00000584243 PHKG2P15735 406 aa10.45□□□□□ -0.74
GGA3-218ENST00000584243 AMPHP49418 695 aa10.45□□□□□ -0.74
GGA3-218ENST00000584243 AAMPQ13685 434 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms