RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IFFO2Q5TF58 517 aa36.9■■■■□ 3.5
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IQCA1LA6NCM1 817 aa36.88■■■■□ 3.49
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POTEJP0CG39 1038 aa36.86■■■■□ 3.49
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CRAMP1Q96RY5 1269 aa36.84■■■■□ 3.49
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.8■■■■□ 3.48
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.79■■■■□ 3.48
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ISCA1Q9BUE6 129 aa36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VPS33BQ9H267 617 aa36.6■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TAF1P21675 1872 aa36.59■■■■□ 3.45
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MPNDQ8N594 471 aa36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM89AQ96GI7 184 aa36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
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