RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPDO75976 1380 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP6P35125 1406 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SSH2Q76I76 1423 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 KCNH2Q12809 1159 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 ABTB2Q8N961 1025 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 SBF2Q86WG5 1849 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8-202ENST00000577426 TOMM70O94826 608 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHRNA2Q15822 529 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP54Q70EL1 1684 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 RREB1Q92766 1687 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 APBB1O00213 710 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 NR6A1Q15406 480 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 NLRP13Q86W25 1043 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 UTRNP46939 3433 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 PEAK1Q9H792 1746 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 EVC2Q86UK5 1308 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC37A3O60309 1634 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 LTN1O94822 1766 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 GCP02774 474 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 NEUROD1Q13562 356 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 MTFR1LQ9H019 292 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 STRN4Q9NRL3 753 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 CABP1Q9NZU7 370 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP10Q9P2G4 905 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 EVA1CP58658 441 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 PNMA1Q8ND90 353 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 ABHD8Q96I13 439 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRB1P82279 1406 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 NFAT5O94916 1531 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 ABCC6O95255 1503 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC19A1P41440 591 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPIAP49247 311 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 RGS19P49795 217 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 MCM6Q14566 821 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 MYOM1P52179 1685 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 DLL1O00548 723 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 STK32BQ9NY57 414 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP35Q9P2H5 1018 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAD21O60216 631 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 BAP1Q92560 729 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP3K5Q99683 1374 aa7.15□□□□□ -1.26
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TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM32Q13049 653 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDE3BQ13370 1112 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP31Q70CQ4 1352 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.14□□□□□ -1.27
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TRAPPC8-202ENST00000577426 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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TRAPPC8-202ENST00000577426 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.13□□□□□ -1.27
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TRAPPC8-202ENST00000577426 TONSLQ96HA7 1378 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPRYD7Q5W111 196 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 NHSQ6T4R5 1651 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 BCL9O00512 1426 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC8-202ENST00000577426 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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