RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 PSMD1Q99460 953 aa18.13■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.13■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 MYL6BP14649 208 aa18.12■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 SUSD4Q5VX71 490 aa18.12■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 NTSR2O95665 410 aa18.11■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.11■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.11■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 GPC2Q8N158 579 aa18.11■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.11■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 NFE2L2Q16236 605 aa18.1■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 CNTROBQ8N137 903 aa18.1■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 NYXQ9GZU5 481 aa18.1■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 SCNN1DP51172 638 aa18.09■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 LAMB2P55268 1798 aa18.09■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 RASSF10A6NK89 507 aa18.08■□□□□ 0.48
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SPNS3-202ENST00000572078 PDIA6Q15084 440 aa18.08■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.08■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
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SPNS3-202ENST00000572078 WBP1LQ9NX94 342 aa18.08■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.08■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.08■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 EPS15P42566 896 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 PROSER3Q2NL68 480 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 ANXA1P04083 346 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.06■□□□□ 0.48
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SPNS3-202ENST00000572078 JDP2Q8WYK2 163 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 LBX1P52954 281 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 EIF6P56537 245 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 ABCC4O15439 1325 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 ERBB4Q15303 1308 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 TRAF5O00463 557 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
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SPNS3-202ENST00000572078 TAF1P21675 1872 aa18.03■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 AOC3Q16853 763 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.02■□□□□ 0.48
SPNS3-202ENST00000572078 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 NEFMP07197 916 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
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SPNS3-202ENST00000572078 CST9Q5W186 159 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 AIDAQ96BJ3 306 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 COL4A1P02462 1669 aa18.01■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 PPIP5K2O43314 1243 aa18■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 PARP10Q53GL7 1025 aa18■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 NIM1KQ8IY84 436 aa18■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 CXCL9Q07325 125 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 KRT24Q2M2I5 525 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 NLRP3Q96P20 1036 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 CYP4F22Q6NT55 531 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
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SPNS3-202ENST00000572078 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 LRRC37AA6NMS7 1700 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 RIPK4P57078 832 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 NLRP10Q86W26 655 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 CAPNS2Q96L46 248 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 SHTN1A0MZ66 631 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 COPS6Q7L5N1 327 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.96■□□□□ 0.47
SPNS3-202ENST00000572078 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-202ENST00000572078 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-202ENST00000572078 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-202ENST00000572078 GRM1Q13255 1194 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-202ENST00000572078 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-202ENST00000572078 TLL2Q9Y6L7 1015 aa17.95■□□□□ 0.46
SPNS3-202ENST00000572078 YDJCA8MPS7 323 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS3-202ENST00000572078 AOC2O75106 756 aa17.94■□□□□ 0.46
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