RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM177BA6PVY3 158 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 HLFQ16534 295 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF6Q6ZMV9 814 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 CREBZFQ9NS37 354 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 PCNTO95613 3336 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 CACNA1SQ13698 1873 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 HOXB7P09629 217 aa25.99■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 MYL6BP14649 208 aa25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 LDHDQ86WU2 507 aa25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 ANXA1P04083 346 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 NGEFQ8N5V2 710 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 NECTIN2Q92692 538 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF521Q96K83 1311 aa25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 CRY2Q49AN0 593 aa25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 WDR63Q8IWG1 891 aa25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-210ENST00000559586 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 SCN4AP35499 1836 aa25.95■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 NUP98P52948 1817 aa25.94■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 SYNE4Q8N205 404 aa25.94■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 PSMD1Q99460 953 aa25.94■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 TSPYL6Q8N831 410 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 JDP2Q8WYK2 163 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 HACL1Q9UJ83 578 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 POTEIP0CG38 1075 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 POTEJP0CG39 1038 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 TNS4Q8IZW8 715 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 FZD9O00144 591 aa25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.9■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 OLFM4Q6UX06 510 aa25.9■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.9■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 GPC2Q8N158 579 aa25.9■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 PASKQ96RG2 1323 aa25.89■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.89■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.89■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.89■■□□□ 1.74
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RABGGTA-210ENST00000559586 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 COPS6Q7L5N1 327 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 GPTP24298 496 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 SUSD4Q5VX71 490 aa25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 CNTNAP1P78357 1384 aa25.84■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 NLRP3Q96P20 1036 aa25.84■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 SNED1Q8TER0 1413 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 NTSR2O95665 410 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-210ENST00000559586 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 HYPKQ9NX55 129 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 VPS33BQ9H267 617 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 GOLGA2Q08379 1002 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 CNTROBQ8N137 903 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 VAMP4O75379 141 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-210ENST00000559586 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.79■■□□□ 1.72
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