RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PIK3C2GO75747 1445 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 MAN1A2O60476 641 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 STK26Q9P289 416 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 MSH6P52701 1360 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 KIF1AQ12756 1690 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 TTLL8A6PVC2 850 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 HSPA1LP34931 641 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 RNF135Q8IUD6 432 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ADGRB1O14514 1584 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 TRAK2O60296 914 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PTGIRP43119 386 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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TMOD3-204ENST00000558666 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.23□□□□□ -1.41
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TMOD3-204ENST00000558666 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 ADGRB2O60241 1585 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 AKAP12Q02952 1782 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 POM121CA8CG34 1229 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 SEMA3FQ13275 785 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 NEUROD1Q13562 356 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 RNF217Q8TC41 542 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 MST1RQ04912 1400 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PTCH1Q13635 1447 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-204ENST00000558666 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
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TMOD3-204ENST00000558666 PIK3CDO00329 1044 aa6.21□□□□□ -1.42
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TMOD3-204ENST00000558666 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 LCE2CQ5TA81 110 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 TREML4Q6UXN2 200 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 ALG2Q9H553 416 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 H3BM21 787 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 WFS1O76024 890 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 LRP6O75581 1613 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 PIK3R4Q99570 1358 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.19□□□□□ -1.42
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TMOD3-204ENST00000558666 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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TMOD3-204ENST00000558666 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 TBX22Q9Y458 520 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 ALS2Q96Q42 1657 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 LTN1O94822 1766 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PRU2 124 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 A6NJR5 290 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 MEN1O00255 615 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 ATF3P18847 181 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 PTSQ03393 145 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD3-204ENST00000558666 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.18□□□□□ -1.42
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