RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-240ENST00000556339 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 EPHA4P54764 986 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 BRD7Q9NPI1 651 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SYNJ1O43426 1573 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SYNJ2O15056 1496 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 ARAP1Q96P48 1450 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SFI1A8K8P3 1242 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 ADH7P40394 386 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 OGFOD1Q8N543 542 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 NACC1Q96RE7 527 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SLC30A3Q99726 388 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 WDR97A6NE52 1622 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 POM121CA8CG34 1229 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 FAM229AH3BQW9 127 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 FLIIQ13045 1269 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 TNFRSF25Q93038 417 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 IGFLR1Q9H665 355 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 ATP9BO43861 1147 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 CLDN10P78369 228 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 BHMTQ93088 406 aa6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ATXN3-240ENST00000556339 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ALBP02768 609 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 HIF1AQ16665 826 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 NGLY1Q96IV0 654 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 PBRM1Q86U86 1689 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 SUSD3Q96L08 255 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 PNMA5Q96PV4 448 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 LILRB5O75023 590 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 RASA1P20936 1047 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 TYRO3Q06418 890 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 M0R2N6 131 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 GRIK4Q16099 956 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 UCN2Q96RP3 112 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 MDFIQ99750 246 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 HINFPQ9BQA5 517 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 SEC13P55735 322 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 RAC1P63000 192 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 SIX5Q8N196 739 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 GRIN2AQ12879 1464 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 TOP2BQ02880 1626 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 NID1P14543 1247 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 KCNQ4P56696 695 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 NUDT8Q8WV74 236 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-240ENST00000556339 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 C9orf172C9J069 976 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 DYRK3O43781 588 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 EPB42P16452 691 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 GLMNQ92990 594 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-240ENST00000556339 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms