RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TTC22Q5TAA0 569 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 KSR2Q6VAB6 950 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 MBIPQ9NS73 344 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 DCAF5Q96JK2 942 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 IL2RBP14784 551 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 FOXO3O43524 673 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC96Q2M329 555 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NEBLO76041 1014 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NLRP5P59047 1200 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA1328Q86T90 577 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 AOX1Q06278 1338 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 HOOK3Q86VS8 718 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 YEATS4O95619 227 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 STX1AQ16623 288 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 ATL3Q6DD88 541 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 TRIM27P14373 513 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 ATP8B2P98198 1209 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 SBNO1A3KN83 1393 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 PARP10Q53GL7 1025 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 PAF1Q8N7H5 531 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 ZMYM3Q14202 1370 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R2P41236 205 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 HOOK2Q96ED9 719 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 SETDB2Q96T68 719 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 KIF4AO95239 1232 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NUCB1Q02818 461 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 ESR2Q92731 530 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NEK1Q96PY6 1258 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NBPF4Q96M43 638 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 TUBB4BP68371 445 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 SPAG1Q07617 926 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 MAST3O60307 1309 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC45Q96CN5 670 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NLRP3Q96P20 1036 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 KIF5CO60282 957 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 SH2D4AQ9H788 454 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 RNF214Q8ND24 703 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 LINS1Q8NG48 757 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 IP6K1Q92551 441 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 SHROOM2Q13796 1616 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NBPF14Q5TI25 921 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 FERMT2Q96AC1 680 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 CALML3P27482 149 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA0754O94854 1291 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 CEP170Q5SW79 1584 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-208ENST00000550358 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms