RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 SNED1Q8TER0 1413 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 GPTP24298 496 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 NFE2L2Q16236 605 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 SUSD4Q5VX71 490 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 AIDAQ96BJ3 306 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 RASSF10A6NK89 507 aa21.27■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.27■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 WBP1LQ9NX94 342 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRU-210ENST00000527027 ERBB4Q15303 1308 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 NTSR2O95665 410 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.25■□□□□ 0.99
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PTPRU-210ENST00000527027 EPS15P42566 896 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 PARP10Q53GL7 1025 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 NLRP3Q96P20 1036 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 SCNN1DP51172 638 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 NUP98P52948 1817 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.22■□□□□ 0.99
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PTPRU-210ENST00000527027 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
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PTPRU-210ENST00000527027 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRU-210ENST00000527027 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
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PTPRU-210ENST00000527027 BBOX1O75936 387 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRU-210ENST00000527027 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRU-210ENST00000527027 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRU-210ENST00000527027 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
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PTPRU-210ENST00000527027 COPS6Q7L5N1 327 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRU-210ENST00000527027 SP8Q8IXZ3 490 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRU-210ENST00000527027 TRAF5O00463 557 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
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PTPRU-210ENST00000527027 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 NLRP10Q86W26 655 aa21.13■□□□□ 0.97
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PTPRU-210ENST00000527027 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
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PTPRU-210ENST00000527027 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 NECTIN2Q92692 538 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 TCIRG1Q13488 830 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRU-210ENST00000527027 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
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