RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NBPF15Q8N660 670 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GJA3Q9Y6H8 435 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HLFQ16534 295 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OLFM4Q6UX06 510 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIC1Q4ADV7 1423 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NIM1KQ8IY84 436 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCTN1Q14203 1278 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NGEFQ8N5V2 710 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABHD8Q96I13 439 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAPNS2Q96L46 248 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CRAMP1Q96RY5 1269 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VPS33BQ9H267 617 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCC12Q96J65 1359 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUPT20HQ8NEM7 779 aa12.26□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SNED1Q8TER0 1413 aa12.26□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CA12O43570 354 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP2R1AP30153 589 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SCNN1DP51172 638 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PARP10Q53GL7 1025 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NLRP3Q96P20 1036 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERBB4Q15303 1308 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPIP5K2O43314 1243 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYL6BP14649 208 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPTP24298 496 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP2K2P36507 400 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EPS15P42566 896 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRM1Q13255 1194 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 THSD7BQ9C0I4 1608 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDHR2Q9BYE9 1310 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CYP4F22Q6NT55 531 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TLL2Q9Y6L7 1015 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUP98P52948 1817 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UBN2Q6ZU65 1347 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NTSR2O95665 410 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM161AQ3B820 660 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUSD4Q5VX71 490 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPRC5DQ9NZD1 345 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNRF3Q9ULT6 936 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa12.22□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRPM7Q96QT4 1865 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC85CA6NKD9 419 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNIP1Q15025 636 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AOC3Q16853 763 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF34Q8IZ26 560 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL4A5P29400 1685 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LTBP1Q14766 1721 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRAF5O00463 557 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BBOX1O75936 387 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CELF2O95319 508 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NFE2L2Q16236 605 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CST9Q5W186 159 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CIAPIN1Q6FI81 312 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC34A2O95436 690 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CXCL9Q07325 125 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDC37L1Q7L3B6 337 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMC4Q7Z404 712 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SP8Q8IXZ3 490 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MPNDQ8N594 471 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCC4O15439 1325 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 H7C1D1 291 aa12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms