RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.73□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR7Q8TB68 274 aa10.73□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.73□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 TREML4Q6UXN2 200 aa10.72□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.72□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 SBF2Q86WG5 1849 aa10.72□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.71□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 CPDO75976 1380 aa10.71□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.71□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 PTPRNQ16849 979 aa10.71□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.7□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF827Q17R98 1081 aa10.7□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.7□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.7□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATP7BP35670 1465 aa10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRIM66O15016 1216 aa10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 SH3BP2P78314 561 aa10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 AK7Q96M32 723 aa10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 WDR17Q8IZU2 1322 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 SIAH2O43255 324 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRELPP51888 382 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNH2Q12809 1159 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 SENP2Q9HC62 589 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.68□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC01559Q495D7 138 aa10.67□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.67□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 BAP1Q92560 729 aa10.67□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.67□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 AATKQ6ZMQ8 1374 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNQ4P56696 695 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 MSL1Q68DK7 614 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 DESI1Q6ICB0 168 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.66□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 USP19O94966 1318 aa10.65□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 PEAK1Q9H792 1746 aa10.65□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 GJA5P36382 358 aa10.65□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.65□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 USP6P35125 1406 aa10.65□□□□□ -0.7
MSC-AS1-202ENST00000512290 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.64□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 WFS1O76024 890 aa10.64□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 TOMM70O94826 608 aa10.64□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 CTHP32929 405 aa10.64□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 AKAP12Q02952 1782 aa10.63□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.63□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNH5Q8NCM2 988 aa10.63□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIFC2Q96AC6 838 aa10.63□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRIM47Q96LD4 638 aa10.63□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 CD2APQ9Y5K6 639 aa10.63□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 BCL9O00512 1426 aa10.63□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 ITSN1Q15811 1721 aa10.62□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPTLC1O15269 473 aa10.62□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.62□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 LRRC37A3O60309 1634 aa10.62□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 IL2RBP14784 551 aa10.61□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 LYPD8Q6UX82 237 aa10.61□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF511Q8NB15 262 aa10.61□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 KLRG1Q96E93 195 aa10.61□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 CABP1Q9NZU7 370 aa10.61□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC7Q96M83 1385 aa10.61□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCNTO95613 3336 aa10.61□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 LMO7Q8WWI1 1683 aa10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 CFAP99D6REC4 459 aa10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 HTRA3P83110 453 aa10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARHGEF25Q86VW2 580 aa10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.6□□□□□ -0.71
MSC-AS1-202ENST00000512290 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa10.58□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 PDE4DQ08499 809 aa10.58□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms