RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 SUSD4Q5VX71 490 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 GPC2Q8N158 579 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 PASKQ96RG2 1323 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.52■■□□□ 1.04
ITGA3-211ENST00000508100 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.52■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.52■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 RIPK4P57078 832 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 PCNTO95613 3336 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 PARP10Q53GL7 1025 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 NLRP3Q96P20 1036 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 CNTNAP1P78357 1384 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 NTSR2O95665 410 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 CNTROBQ8N137 903 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 RALBP1Q15311 655 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 SNED1Q8TER0 1413 aa21.46■■□□□ 1.03
ITGA3-211ENST00000508100 PDIA6Q15084 440 aa21.45■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 NIM1KQ8IY84 436 aa21.45■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 AIDAQ96BJ3 306 aa21.45■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 VEGFBP49765 207 aa21.44■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.44■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.44■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 ANXA1P04083 346 aa21.43■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 PROSER3Q2NL68 480 aa21.43■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.43■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.43■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 NECTIN2Q92692 538 aa21.43■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 PPIP5K2O43314 1243 aa21.42■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 COPS6Q7L5N1 327 aa21.42■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.42■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 FOXN1O15353 648 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 NEUROD2Q15784 382 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 VPS33BQ9H267 617 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 EPS15P42566 896 aa21.4■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 AOC3Q16853 763 aa21.4■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.4■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 COL4A5P29400 1685 aa21.4■■□□□ 1.02
ITGA3-211ENST00000508100 ABCC4O15439 1325 aa21.39■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 BBOX1O75936 387 aa21.39■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 SCNN1DP51172 638 aa21.39■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 SLC51AQ86UW1 340 aa21.39■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 RASSF10A6NK89 507 aa21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 TCIRG1Q13488 830 aa21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 NLRP10Q86W26 655 aa21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 SP8Q8IXZ3 490 aa21.37■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.37■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.36■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 CHL1O00533 1208 aa21.36■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 MPNDQ8N594 471 aa21.36■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 RUNDC1Q96C34 613 aa21.35■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 WBP1LQ9NX94 342 aa21.35■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 CXCL9Q07325 125 aa21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 KRT24Q2M2I5 525 aa21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 LTBP1Q14766 1721 aa21.34■■□□□ 1.01
ITGA3-211ENST00000508100 GRAPQ13588 217 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms