RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 GPTP24298 496 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 NFE2L2Q16236 605 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 EIF6P56537 245 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 NTSR2O95665 410 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC51AQ86UW1 340 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 RASSF10A6NK89 507 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 WBP1LQ9NX94 342 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 ERBB4Q15303 1308 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 SCN4AP35499 1836 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 SCNN1DP51172 638 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 PDIA6Q15084 440 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 AIDAQ96BJ3 306 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 COL4A5P29400 1685 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP2-205ENST00000502260 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 EPS15P42566 896 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 RALBP1Q15311 655 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 PARP10Q53GL7 1025 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 CACNA1SQ13698 1873 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 NLRP3Q96P20 1036 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 PPIP5K2O43314 1243 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 LBX1P52954 281 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 PROSER3Q2NL68 480 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 NIM1KQ8IY84 436 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 ANXA1P04083 346 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 RIPK4P57078 832 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 AOC3Q16853 763 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 VPS33BQ9H267 617 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 ABCC4O15439 1325 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-205ENST00000502260 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 LTBP1Q14766 1721 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAF5O00463 557 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 BBOX1O75936 387 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 CXCL9Q07325 125 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 CST9Q5W186 159 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 COPS6Q7L5N1 327 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 NLRP10Q86W26 655 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 SP8Q8IXZ3 490 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 NECTIN2Q92692 538 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 CAPNS2Q96L46 248 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 ECE1P42892 770 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 TCIRG1Q13488 830 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 MPNDQ8N594 471 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-205ENST00000502260 GRAPQ13588 217 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms