RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	HTRA3	P83110	453 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PIM2	Q9P1W9	311 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		14.94	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	GYS1	P13807	737 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	14.93	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF181	Q9P0P0	153 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CABP4	P57796	275 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	FSTL1	Q12841	308 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRG1	Q96E93	195 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NCAPD2	Q15021	1401 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6KA4	O75676	772 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	HCST	Q9UBK5	93 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	KDR	P35968	1356 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF5	Q96JK2	942 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RRAGC	Q9HB90	399 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TNS4	Q8IZW8	715 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	POLK	Q9UBT6	870 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR37	O15354	613 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	C4A	P0C0L4	1744 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAP	O00193	183 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNA3	P22001	575 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNA5	P30532	468 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MTHFS	P49914	203 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	JMY	Q8N9B5	988 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR90	Q96KV7	1748 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZPR1	O75312	459 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OAT	P04181	439 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LRCH3	Q96II8	777 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	DDR1	Q08345	913 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf80	F5H4A9	247 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	RASSF7	Q02833	373 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A3	P48751	1232 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PRELP	P51888	382 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN5	P54829	565 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		14.8	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LMNB1	P20700	586 aa		14.79	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GLTPD2	A6NH11	291 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		14.78	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		14.77	□□□□□ -0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB2	P25686	324 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TM4SF1	P30408	202 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAM	P50895	628 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL6	Q8N841	843 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NECTIN2	Q92692	538 aa		14.77	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FECH	P22830	423 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		14.76	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YIN7	160 aa		14.75	□□□□□ -0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NFIX	Q14938	502 aa		14.75	□□□□□ -0.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.1 ms