RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493831.1

ETV1-222, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 2

Gene ETV1, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-222	ENST00000493831	ZIC5	Q96T25	663 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ATG7	O95352	703 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	POTEA	Q6S8J7	498 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ELOA3	Q8NG57	546 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	TRIM11	Q96F44	468 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	MARK1	Q9P0L2	795 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ITGB7	P26010	798 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	KLF15	Q9UIH9	416 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	IGFBP4	P22692	258 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	WEE1	P30291	646 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	NEUROD1	Q13562	356 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	NBPF11	Q86T75	865 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	HCN2	Q9UL51	889 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	PRMT3	O60678	531 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	SIN3B	O75182	1162 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ARTN	Q5T4W7	220 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	SYT9	Q86SS6	491 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	NGLY1	Q96IV0	654 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ARID3A	Q99856	593 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	EFS	O43281	561 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	DYRK3	O43781	588 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	OCLN	Q16625	522 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	SLAIN2	Q9P270	581 aa		5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
ETV1-222	ENST00000493831	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831		M0R082	166 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		5.64	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.63	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	FOXO3	O43524	673 aa		5.63	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	SUSD3	Q96L08	255 aa		5.63	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	STRN4	Q9NRL3	753 aa		5.63	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	C9orf172	C9J069	976 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	FBXO41	Q8TF61	875 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	TNFRSF25	Q93038	417 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	BCS1L	Q9Y276	419 aa		5.62	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	CARNS1	A5YM72	827 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	RTN1	Q16799	776 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	MDFI	Q99750	246 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	KLK14	Q9P0G3	267 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	ADH7	P40394	386 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	DGKZ	Q13574	1117 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	LRP8	Q14114	963 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	CEP63	Q96MT8	703 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		5.6	□□□□□ -1.51
ETV1-222	ENST00000493831	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		5.6	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms