RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	OPLAH	O14841	1288 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	MASP1	P48740	699 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PSEN2	P49810	448 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163		A6NJY4	79 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	EYA4	O95677	639 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP4C	P60510	307 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PSMD2	Q13200	908 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	RPIA	P49247	311 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PAK2	Q13177	524 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	KCNQ4	P56696	695 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	CYLD	Q9NQC7	956 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.25	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	DNAJC6	O75061	913 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SPSB2	Q99619	263 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ABL1	P00519	1130 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	COL6A1	P12109	1028 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	GPC1	P35052	558 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	BAP1	Q92560	729 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	KRT85	P78386	507 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	LMNB2	Q03252	620 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	NME8	Q8N427	588 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	KIF4A	O95239	1232 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PMM1	Q92871	262 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM221A	A4D161	298 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	INPP5B	P32019	993 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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