RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 GPC2Q8N158 579 aa22.48■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.48■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 SNED1Q8TER0 1413 aa22.48■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.47■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 SUSD4Q5VX71 490 aa22.46■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.46■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 AIDAQ96BJ3 306 aa22.46■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.46■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 COL4A5P29400 1685 aa22.46■■□□□ 1.19
TOP3B-217ENST00000489581 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 SLC51AQ86UW1 340 aa22.45■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.45■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 NFE2L2Q16236 605 aa22.44■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.44■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 LTBP1Q14766 1721 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.42■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 WBP1LQ9NX94 342 aa22.42■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 RASSF10A6NK89 507 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 NTSR2O95665 410 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 EPS15P42566 896 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 LBX1P52954 281 aa22.4■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.4■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TOP3B-217ENST00000489581 SCNN1DP51172 638 aa22.39■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.39■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.38■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.38■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.38■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 ERBB4Q15303 1308 aa22.37■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 NIM1KQ8IY84 436 aa22.37■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 NLRP3Q96P20 1036 aa22.37■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 PPIP5K2O43314 1243 aa22.36■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 ANXA1P04083 346 aa22.36■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 AOC3Q16853 763 aa22.36■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 PARP10Q53GL7 1025 aa22.36■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 PDIA6Q15084 440 aa22.35■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.35■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 PROSER3Q2NL68 480 aa22.34■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.34■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 TRAF5O00463 557 aa22.33■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.33■■□□□ 1.17
TOP3B-217ENST00000489581 LAMB2P55268 1798 aa22.33■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 RIPK4P57078 832 aa22.32■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 GRM1Q13255 1194 aa22.32■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 NECTIN2Q92692 538 aa22.32■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 ABCC4O15439 1325 aa22.31■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 TAF1P21675 1872 aa22.31■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 CST9Q5W186 159 aa22.31■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 CAPNS2Q96L46 248 aa22.31■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.31■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.3■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 CXCL9Q07325 125 aa22.3■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.3■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 VPS33BQ9H267 617 aa22.3■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 COPS6Q7L5N1 327 aa22.29■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.29■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.29■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 BBOX1O75936 387 aa22.28■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 ECE1P42892 770 aa22.28■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.28■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 NLRP10Q86W26 655 aa22.27■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 SP8Q8IXZ3 490 aa22.27■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 MPNDQ8N594 471 aa22.27■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.27■■□□□ 1.16
TOP3B-217ENST00000489581 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.26■■□□□ 1.15
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF428Q96B54 188 aa22.26■■□□□ 1.15
TOP3B-217ENST00000489581 ABHD8Q96I13 439 aa22.26■■□□□ 1.15
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