RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 ZBTB33Q86T24 672 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 NGEFQ8N5V2 710 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 PNMA1Q8ND90 353 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 NUDCQ9Y266 331 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 C3P01024 1663 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 PTCH1Q13635 1447 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 A0A1W2PP64 1363 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 PIK3R4Q99570 1358 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF521Q96K83 1311 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ZBBXA8MT70 800 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 HPS1Q92902 700 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 POGKQ9P215 609 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 TBX22Q9Y458 520 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 NEFLP07196 543 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 LTKP29376 864 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 GRM5P41594 1212 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 CDK15Q96Q40 435 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 CDK19Q9BWU1 502 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 STK26Q9P289 416 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 GDF11O95390 407 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 NR1H3Q13133 447 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 HOMEZQ8IX15 550 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 MPNDQ8N594 471 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 PTPRUQ92729 1446 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ERBB4Q15303 1308 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ADH1CP00326 375 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 NR3C2P08235 984 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 VEGFBP49765 207 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 VAC14Q08AM6 782 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 NNTQ13423 1086 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 MORC1Q86VD1 984 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 EID1Q9Y6B2 187 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4A-208ENST00000489247 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 POM121CA8CG34 1229 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 H3BM21 787 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 FSHRP23945 695 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 FYB1O15117 783 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 RASSF7Q02833 373 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 SHPRHQ149N8 1683 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 RAB15P59190 212 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 SSH2Q76I76 1423 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 WWC1Q8IX03 1113 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 CABP1Q9NZU7 370 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 MTHFSP49914 203 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC27Q2M243 656 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 CFAP53Q96M91 514 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4A-208ENST00000489247 NR5A1Q13285 461 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms