RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 CHADLQ6NUI6 762 aa29.4■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 IARSP41252 1262 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.39■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 SLC51AQ86UW1 340 aa29.38■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 NECTIN2Q92692 538 aa29.38■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 CHL1O00533 1208 aa29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 PSMD1Q99460 953 aa29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.37■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 SCN4AP35499 1836 aa29.36■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.36■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 FZD9O00144 591 aa29.36■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 KRT24Q2M2I5 525 aa29.36■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 PARP10Q53GL7 1025 aa29.36■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.36■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.35■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 RUNDC1Q96C34 613 aa29.35■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 CRAMP1Q96RY5 1269 aa29.35■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 COPS6Q7L5N1 327 aa29.34■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.34■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 SLC10A5Q5PT55 438 aa29.33■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.33■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
POLR2F-211ENST00000488684 COL4A5P29400 1685 aa29.32■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 LDHDQ86WU2 507 aa29.32■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 NLRP3Q96P20 1036 aa29.31■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 HACL1Q9UJ83 578 aa29.3■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 JDP2Q8WYK2 163 aa29.29■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.28■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 PASKQ96RG2 1323 aa29.28■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 NLRP10Q86W26 655 aa29.28■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 GPC2Q8N158 579 aa29.28■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 CREBZFQ9NS37 354 aa29.28■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.27■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 EPHX2P34913 555 aa29.27■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 TCIRG1Q13488 830 aa29.27■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.27■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
POLR2F-211ENST00000488684 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.26■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.26■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 LARGE2Q8N3Y3 721 aa29.24■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa29.24■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa29.24■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC4O15439 1325 aa29.23■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 EIF6P56537 245 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.23■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 GJA3Q9Y6H8 435 aa29.23■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 LAMB2P55268 1798 aa29.22■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.22■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF428Q96B54 188 aa29.22■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 CFAP44Q96MT7 982 aa29.21■■■□□ 2.27
POLR2F-211ENST00000488684 HOXB7P09629 217 aa29.2■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.19■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 LTBP1Q14766 1721 aa29.19■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 SH3TC1Q8TE82 1336 aa29.19■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 PPIP5K2O43314 1243 aa29.18■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 BBOX1O75936 387 aa29.18■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 AOC3Q16853 763 aa29.18■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.18■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.18■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 CNTROBQ8N137 903 aa29.18■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 MBIPQ9NS73 344 aa29.18■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 EPS15P42566 896 aa29.17■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 SCNN1DP51172 638 aa29.17■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 SP8Q8IXZ3 490 aa29.17■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 TAF1P21675 1872 aa29.17■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF853P0CG23 659 aa29.16■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 NIM1KQ8IY84 436 aa29.16■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 ISCA1Q9BUE6 129 aa29.16■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 CNTNAP1P78357 1384 aa29.15■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.15■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 APAF1O14727 1248 aa29.15■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 VPS33BQ9H267 617 aa29.15■■■□□ 2.26
POLR2F-211ENST00000488684 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 GRAPQ13588 217 aa29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
POLR2F-211ENST00000488684 MPNDQ8N594 471 aa29.13■■■□□ 2.25
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