RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.18□□□□□ -0.62
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SH3BP1-204ENST00000459646 POTEJP0CG39 1038 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 PROSER3Q2NL68 480 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 PARP10Q53GL7 1025 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 COPS6Q7L5N1 327 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.18□□□□□ -0.62
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SH3BP1-204ENST00000459646 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.16□□□□□ -0.62
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SH3BP1-204ENST00000459646 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.15□□□□□ -0.62
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SH3BP1-204ENST00000459646 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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SH3BP1-204ENST00000459646 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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SH3BP1-204ENST00000459646 NLRP10Q86W26 655 aa11.13□□□□□ -0.63
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SH3BP1-204ENST00000459646 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM89AQ96GI7 184 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 CFAP44Q96MT7 982 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 MBIPQ9NS73 344 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 RIMBP2O15034 1052 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SH3BP1-204ENST00000459646 GNAI1P63096 354 aa11.09□□□□□ -0.63
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