RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.41□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.41□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.41□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.41□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 SERPINB2P05120 415 aa11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 NFIXQ14938 502 aa11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 PDIA6Q15084 440 aa11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 MSL1Q68DK7 614 aa11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 ATP10DQ9P241 1426 aa11.4□□□□□ -0.58
PAICSP3-201ENST00000428007 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 MYL6BP14649 208 aa11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 E2F4Q16254 413 aa11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 CNBD1Q8NA66 436 aa11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.39□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 H0YIN7 160 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 TCIRG1Q13488 830 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 SOGA3Q5TF21 947 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 COPS6Q7L5N1 327 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 PIM2Q9P1W9 311 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.38□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.37□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 VAMP4O75379 141 aa11.37□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 SLFN5Q08AF3 891 aa11.37□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.37□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.37□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.37□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.37□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 C4AP0C0L4 1744 aa11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 SEMA3EO15041 775 aa11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 GPR162Q16538 588 aa11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 CNKSR1Q969H4 720 aa11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 ALDH1B1P30837 517 aa11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 DDR1Q08345 913 aa11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 STYK1Q6J9G0 422 aa11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 KSR2Q6VAB6 950 aa11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 SMIM5Q71RC9 77 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 MASTLQ96GX5 879 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 NLRP3Q96P20 1036 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 PTPRCP08575 1304 aa11.34□□□□□ -0.59
PAICSP3-201ENST00000428007 SCN7AQ01118 1682 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 NPR1P16066 1061 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 HLFQ16534 295 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 KRT24Q2M2I5 525 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 TMC4Q7Z404 712 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 TSPYL6Q8N831 410 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 TTLL6Q8N841 843 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.33□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.32□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 FLIIQ13045 1269 aa11.32□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 NECTIN2Q92692 538 aa11.32□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.32□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 CACNA1FO60840 1977 aa11.32□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 SRGNP10124 158 aa11.31□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 PROSER3Q2NL68 480 aa11.31□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 CRY2Q49AN0 593 aa11.31□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 NLRP10Q86W26 655 aa11.31□□□□□ -0.6
PAICSP3-201ENST00000428007 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms