RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391293.1

5S_rRNA.2-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 112 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 EVI5O60447 810 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NLRP6P59044 892 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 BPTFQ12830 3046 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NRXN2Q9P2S2 1712 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SSC5DA1L4H1 1573 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADGRB1O14514 1584 aa3.04□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NUP155O75694 1391 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KDRP35968 1356 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 COL15A1P39059 1388 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMIM22K7EJ46 135 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RFC4P35249 363 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 THEGQ9P2T0 379 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PLEKHG3A1L390 1219 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 H0YIN7 160 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SOX12O15370 315 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TM4SF1P30408 202 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CDC37L1Q7L3B6 337 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SEMA6BQ9H3T3 888 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 POGKQ9P215 609 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GJA3Q9Y6H8 435 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CACNA1HO95180 2353 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SLX4Q8IY92 1834 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PRR33A8MZF0 331 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TM4SF4P48230 202 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CD99L2Q8TCZ2 262 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C7orf43Q8WVR3 580 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PIGBQ92521 554 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 EFCC1Q9HA90 598 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LTN1O94822 1766 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KDM3BQ7LBC6 1761 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAM186AA6NE01 2351 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TJP1Q07157 1748 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ALPK3Q96L96 1907 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GFRA3O60609 400 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RPS6KA4O75676 772 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 BMP1P13497 986 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SYN1P17600 705 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ATP6V1AP38606 617 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IARSP41252 1262 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GJA8P48165 433 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NFIXQ14938 502 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MTFR1Q15390 333 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CCDC93Q567U6 631 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SOGA3Q5TF21 947 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 OLFM4Q6UX06 510 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NBPF11Q86T75 865 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 USP48Q86UV5 1035 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C7orf61Q8IZ16 206 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KCNH5Q8NCM2 988 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IL27Q8NEV9 243 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ERO1AQ96HE7 468 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KCNH6Q9H252 994 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms