RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABCC12Q96J65 1359 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNED1Q8TER0 1413 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEFMP07197 916 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPTP24298 496 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYL6BP14649 208 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-204ENST00000373166 EPS15P42566 896 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCNN1DP51172 638 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUSD4Q5VX71 490 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 ECE1P42892 770 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 NIM1KQ8IY84 436 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABHD8Q96I13 439 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAPNS2Q96L46 248 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL4A5P29400 1685 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 NLRP3Q96P20 1036 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPIP5K2O43314 1243 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 NTSR2O95665 410 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 VPS33BQ9H267 617 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRM1Q13255 1194 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 PARP10Q53GL7 1025 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 CST9Q5W186 159 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERBB4Q15303 1308 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAF5O00463 557 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 NFE2L2Q16236 605 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 AOC3Q16853 763 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC51AQ86UW1 340 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 LTBP1Q14766 1721 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP2K2P36507 400 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 NUP98P52948 1817 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 CXCL9Q07325 125 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-204ENST00000373166 BBOX1O75936 387 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABCC4O15439 1325 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM161AQ3B820 660 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 SP8Q8IXZ3 490 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDIA6Q15084 440 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 MPNDQ8N594 471 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.1■■□□□ 1.61
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