RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362524.1

RNU6-600P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 600, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-600P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-600P-201ENST00000362524 GIPC1O14908 333 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CTSHP09668 335 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CD53P19397 219 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 BDNFP23560 247 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PMLP29590 882 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 GYS2P54840 703 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 EVA1CP58658 441 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 AAMPQ13685 434 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 RASA3Q14644 834 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 MAP9Q49MG5 647 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PDXDC2PQ6P474 469 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ABTB2Q8N961 1025 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 GAS2L2Q8NHY3 880 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 SCINQ9Y6U3 715 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ALG1L2C9J202 215 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CCER2I3L3R5 266 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ANP32CO43423 234 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 FZD6O60353 706 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 KIF4AO95239 1232 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ATP6V1AP38606 617 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 MASP1P48740 699 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 NBPF14Q5TI25 921 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZNF280DQ6N043 979 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 C16orf46Q6P387 395 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 FBXO41Q8TF61 875 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CEP63Q96MT8 703 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 TMEM260Q9NX78 707 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 WBP1LQ9NX94 342 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 HCSTQ9UBK5 93 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PLAAQ9Y263 795 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 USP31Q70CQ4 1352 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 TNFRSF10BO14763 440 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 KLF4O43474 513 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 FGAP02671 866 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 NEFMP07197 916 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 SLC10A3P09131 477 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 COL6A1P12109 1028 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 COPS2P61201 443 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 SPNS2Q8IVW8 549 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 GJD3Q8N144 294 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CASS4Q9NQ75 786 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 RNF19AQ9NV58 838 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ESPNB1AK53 854 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 TSPAN6O43657 245 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 FUT2Q10981 343 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 USP4Q13107 963 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 MYBPC2Q14324 1141 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 TNNI3KQ59H18 835 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 RUNDC1Q96C34 613 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PKNOX2Q96KN3 472 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 CSRNP1Q96S65 589 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 DNAJC25Q9H1X3 360 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 NEUROD4Q9HD90 331 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 STIM2Q9P246 746 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 NRDCO43847 1150 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 COPB2P35606 906 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PWP1Q13610 501 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PTPRNQ16849 979 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-600P-201ENST00000362524 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms