RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LAMA5	O15230	3695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TLR4	O00206	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	P2RY10	O00398	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CETN3	O15182	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HSF2BP	O75031	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SDC3	O75056	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	GRAP2	O75791	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	IL1B	P01584	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC4A1	P02730	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	UGT1A6	P19224	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ITGA3	P26006	1051 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PPP1R2	P41236	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PSMD8	P48556	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DAOA	P59103	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CUL2	Q13617	745 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CDH18	Q13634	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CST6	Q15828	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931		A8MVM7	634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931		M0QYV0	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PSMD3	O43242	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DFNA5	O60443	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	STX10	O60499	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRSS1	P07477	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	KRT3	P12035	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FER	P16591	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	AHCY	P23526	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CDKN1A	P38936	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	METAP1	P53582	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	KLK6	Q92876	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LPAR4	Q99677	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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