RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 DHRS7Q9Y394 339 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 APCP25054 2843 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TLCD2A6NGC4 264 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 RASGRF2O14827 1237 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TSPAN12O95859 305 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 RPN2P04844 631 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2B7P16662 529 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CDH3P22223 829 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PSMB5P28074 263 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TNFRSF8P28908 595 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 STX2P32856 288 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 SHMT2P34897 504 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PRKAA1Q13131 559 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PET117Q6UWS5 81 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CDKL2Q92772 493 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM18Q96B42 140 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 OTULINQ96BN8 352 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 LINGO1Q96FE5 620 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 FOPNLQ96NB1 174 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 RBBP8Q99708 897 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CPNE1Q99829 537 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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ATG4D-210ENST00000588972 MMP27Q9H306 513 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 RHOJQ9H4E5 214 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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ATG4D-210ENST00000588972 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 POMT2Q9UKY4 750 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 AKAP9Q99996 3911 aa7.1□□□□□ -1.27
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ATG4D-210ENST00000588972 C2orf74A8MZ97 194 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 C21orf140B9A014 251 aa7.1□□□□□ -1.27
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ATG4D-210ENST00000588972 CD9P21926 228 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CBSP35520 551 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 NPY4RP50391 375 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 RAB28P51157 221 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R39P59534 338 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 FOXM1Q08050 763 aa7.1□□□□□ -1.27
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ATG4D-210ENST00000588972 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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ATG4D-210ENST00000588972 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.1□□□□□ -1.27
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ATG4D-210ENST00000588972 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TTC23LQ6PF05 361 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 C11orf88Q6PI97 169 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 SPESP1Q6UW49 350 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 GPSM1Q86YR5 675 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 IFT20Q8IY31 132 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 ERGIC1Q969X5 290 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 FAM162AQ96A26 154 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 OR6C1Q96RD1 312 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PKP4Q99569 1192 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF747Q9BV97 191 aa7.1□□□□□ -1.27
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