RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-216	ENST00000583282	CHRNE	Q04844	493 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	KRT72	Q14CN4	511 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	INA	Q16352	499 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	MARCH3	Q86UD3	253 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	OR4C3	Q8NH37	302 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	FBXO27	Q8NI29	283 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TAAR6	Q96RI8	345 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PROK2	Q9HC23	129 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	USP22	Q9UPT9	525 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ACOT7	O00154	380 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SNPH	O15079	494 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	UBOX5	O94941	541 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	BMP2	P12643	396 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	GPX2	P18283	190 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	MAGEA8	P43361	318 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CRISP3	P54108	245 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SCARB2	Q14108	478 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	MAPK11	Q15759	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CD226	Q15762	336 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	APOOL	Q6UXV4	268 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF527	Q8NB42	609 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	LIPT1	Q9Y234	373 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	NIN	Q8N4C6	2090 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	NDUFB5	O43674	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	FADS1	O60427	444 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SOX30	O94993	753 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ANGPTL1	O95841	491 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	NPPA	P01160	153 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SLC6A2	P23975	617 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	GDF1	P27539	372 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ATP12A	P54707	1039 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PSME3	P61289	254 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SLC25A3	Q00325	362 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CDK6	Q00534	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TOMM20	Q15388	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PACS2	Q86VP3	889 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	IFNE	Q86WN2	208 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PTOV1	Q86YD1	416 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF843	Q8N446	348 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	RNF138	Q8WVD3	245 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ARSG	Q96EG1	525 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	SH3GL1	Q99961	368 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CMTM6	Q9NX76	183 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	CALML5	Q9NZT1	146 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	GMEB1	Q9Y692	573 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-216	ENST00000583282	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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