RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	STARD4	Q96DR4	205 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PERP	Q96FX8	193 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	SERHL	Q9NQF3	203 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	THAP1	Q9NVV9	213 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	C1orf109	Q9NX04	203 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	MCM8	Q9UJA3	840 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	SLC22A20	A6NK97	555 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	LINC01387	J3KSC0	135 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	SDHD	O14521	159 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	DYNC1I1	O14576	645 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	T	O15178	435 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	EMC8	O43402	210 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ATP1B1	P05026	303 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	FGF4	P08620	206 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	CT62	P0C5K7	136 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	CD8B	P10966	210 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PEPD	P12955	493 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	CPM	P14384	443 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	S1PR1	P21453	382 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	GPX3	P22352	226 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	SOX18	P35713	384 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	UGT2B10	P36537	528 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PTGDS	P41222	190 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PPIC	P45877	212 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	KCNJ5	P48544	419 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PTH2R	P49190	550 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	SLC18A1	P54219	525 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	CLDN18	P56856	261 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	MAP4K2	Q12851	820 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	KIAA0040	Q15053	153 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ETFDH	Q16134	617 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	NNAT	Q16517	81 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ZNF385B	Q569K4	471 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	BEX5	Q5H9J7	111 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PRR22	Q8IZ63	422 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	HGD	Q93099	445 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	OMA1	Q96E52	524 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	MAGEB18	Q96M61	343 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	SFXN2	Q96NB2	322 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	OR52B2	Q96RD2	323 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	NODAL	Q96S42	347 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	EBF4	Q9BQW3	602 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	FANCF	Q9NPI8	374 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	PRODH2	Q9UF12	536 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		6.19	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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