RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 STARP49675 285 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GALT5-AS1P59052 145 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS26BQ4G0F5 336 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OGFOD2Q6N063 350 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ACAD11Q709F0 780 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TNIP2Q8NFZ5 429 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5M1Q8NGP8 315 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM110BQ8TC76 370 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SFXN5Q8TD22 340 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 G6PC3Q9BUM1 346 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 DPY30Q9C005 99 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 AIG1Q9NVV5 245 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC36A6NLP5 189 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SHISA8B8ZZ34 492 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 HDAC3O15379 428 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ZIC3O60481 467 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SCN2BO60939 215 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ANGPTL1O95841 491 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 DPP4P27487 766 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 IL12AP29459 219 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PRIM2P49643 509 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 LHX2P50458 406 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP9P55211 416 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC73Q6P1J9 531 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OLIG3Q7RTU3 272 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR56A1Q8NGH5 318 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4C3Q8NH37 302 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB5Q8WWX0 329 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SFXN2Q96NB2 322 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF195O14628 629 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN18P56856 261 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 UFM1P61960 85 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SRYQ05066 204 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CD226Q15762 336 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG16L1Q676U5 607 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8J2Q8NGG1 315 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4A15Q8NGL6 344 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 LILRB4Q8NHJ6 448 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP19Q8WTR2 217 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OR7D2Q96RA2 312 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIB1Q96RU8 372 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 STACQ99469 402 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 NPAS1Q99742 590 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3GL2Q99962 352 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBA1CQ9BQE3 449 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CHST11Q9NPF2 352 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 GIN1Q9NXP7 522 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 E9PBE3 544 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 H0Y3Z8 333 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTL6AO96019 429 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 COX6B1P14854 86 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 HK1P19367 917 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 DCST2Q5T1A1 773 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 RAET1LQ5VY80 246 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ARSKQ6UWY0 536 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 PM20D2Q8IYS1 436 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf106Q8NAJ2 232 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ACBD4Q8NC06 268 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TESCQ96BS2 214 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52B2Q96RD2 323 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 BTBD2Q9BX70 525 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTRT3Q9BYD9 372 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGUQ9H490 435 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP22Q9NRW4 184 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 NOTCH2Q04721 2471 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms