RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363172.2

U3.48-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 216 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.48-201ENST00000363172 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.86□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 PDZD2O15018 2839 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 A0A0J9YY10 115 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 H3BML4 177 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GFYI3L273 518 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SOCS6O14544 535 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 HCRTR1O43613 425 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 UGDHO60701 494 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SEC22BO75396 215 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SCELO95171 688 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 RASAL1O95294 804 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SMIM18P0DKX4 95 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CDH1P12830 882 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 UGT2B7P16662 529 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 IL12AP29459 219 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CCR7P32248 378 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SLC6A12P48065 614 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 PRLHRP49683 370 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 NR1H2P55055 460 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CLDN8P56748 225 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SOX8P57073 446 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 TUBA4AP68366 448 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ARG2P78540 354 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 MYBPC1Q00872 1141 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 KIAA0040Q15053 153 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ATP6AP1Q15904 470 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ZIC1Q15915 447 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 NRF1Q16656 503 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 FCRL6Q6DN72 434 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GLYATQ6IB77 296 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 KRT80Q6KB66 452 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GFRALQ6UXV0 394 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ATL1Q8WXF7 558 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CGREF1Q99674 301 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CIB1Q99828 191 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 LHPPQ9H008 270 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 RMND5AQ9H871 391 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 FAM60AQ9NP50 221 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CHST11Q9NPF2 352 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 JKAMPQ9P055 326 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ICKQ9UPZ9 632 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 PDE10AQ9Y233 779 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.85□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CACNA1CQ13936 2221 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 A0A1B0GX78 115 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GAGE12BA1L429 117 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CDHR4A6H8M9 788 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 C9JVG2 144 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 H3BMH7 237 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CCL21O00585 134 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 SLC43A1O75387 559 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 H6PDO95479 791 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 IL1RNP18510 177 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GGT1P19440 569 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 MYF6P23409 242 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 MMP11P24347 488 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GDF5P43026 501 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 GABRA4P48169 554 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 TDGF1P3P51864 188 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 PNLIPRP1P54315 467 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CHRNB3Q05901 458 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 MFAP5Q13361 173 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 TUBA3CQ13748 450 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 APOFQ13790 326 aa6.84□□□□□ -1.31
U3.48-201ENST00000363172 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms