RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sdk2Q6V4S5 2176 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfrsf1bP25119 474 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnaja1P63037 397 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hyal4Q05A56 481 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xrra1Q3U3V8 786 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 RgmaQ6PCX7 454 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1308Q7TQX0 320 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rap2aQ80ZJ1 183 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10330Q8BKS1 112 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r30Q8R2D2 302 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1233Q8VGN0 305 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phf6Q9D4J7 364 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr938Q9EQ93 315 aa10.97□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 A430033K04RikE9Q8G5 680 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm17615E9Q9P2 165 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Speer4cG3UXD1 256 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10354K7N6A0 256 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pmm1O35621 262 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 PpiaP17742 164 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gria1P23818 907 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxa1P35582 468 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tm9sf2P58021 662 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Npdc1Q64322 332 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekha6Q7TQG1 1173 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 SnupnQ80W37 358 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arl14epQ8BIX3 276 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gen1Q8BMI4 908 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 OacylQ8BML2 685 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fignl1Q8BPY9 683 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 RhbgQ8BUX5 455 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 ZxdcQ8C8V1 858 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc61Q8R2R5 259 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr161Q8VGB9 313 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc49Q91YK0 686 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pex13Q9D0K1 405 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp1aQ9EPL5 464 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdzk1Q9JIL4 519 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11214V9GX06 183 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp937A2ANU7 503 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp442A2AQA0 667 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r110E9PWD5 858 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcsk4P29121 655 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nat3P50296 290 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mks1Q5SW45 561 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd55Q61475 390 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zic2Q62520 530 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 DmknQ6P253 517 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8C0X8 640 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neto1Q8R4I7 533 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc7a13Q91WN3 478 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Twsg1Q9EP52 222 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hipk3Q9ERH7 1192 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf207Q9JMD0 495 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slco1a1Q9QXZ6 670 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 Jag2Q9QYE5 1247 aa10.96□□□□□ -0.65
Herc3-201ENSMUST00000031823 FrylF8VQ05 3007 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lama1P19137 3084 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r51L7N215 852 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmc3ipO35047 217 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcp2P12660 120 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 RpsaP14206 295 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmb9P28076 219 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 ThrbP37242 461 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnk2P97438 426 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zc3h14Q8BJ05 735 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam131aQ8BWU3 361 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc35b4Q8CIA5 331 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tceal3Q8R0A5 200 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr350Q8VFP8 312 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr45Q91VM3 360 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 D730048I06RikQ9CQB8 106 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmed5Q9CXE7 229 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Upk1bQ9Z2C6 260 aa10.96□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv16-1A0A0A6YW39 117 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01657 111 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fabp1P12710 127 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdh2P15116 906 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Htr1bP28334 386 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxc5P32043 222 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stt3aP46978 705 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atxn1P54254 791 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nell1Q2VWQ2 810 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr20Q3UWE6 569 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 SynpoQ8CC35 929 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il23rQ8K4B4 644 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 SdslQ8R238 329 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ash2lQ91X20 623 aa10.95□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrkxQ922R0 355 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.5 ms