RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6401L7N2C0 213 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hax1O35387 280 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oprd1P32300 372 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppm1bP36993 390 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtnP63089 168 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem64Q3U145 381 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1orf109Q499E6 217 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AktipQ64362 292 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zadh2Q8BGC4 377 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigtQ8BXQ2 582 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lcmt2Q8BYR1 686 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NotumQ8R116 503 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc26Q91W20 331 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx4Q91YJ2 450 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oosp1Q925U0 202 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a27Q9D6D0 322 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tm9sf3Q9ET30 587 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thbs4Q9Z1T2 963 aa11.88□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dock4P59764 1978 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trbv20A0A0B4J1H5 111 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgm2A2CEK3 580 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8180E9PXN0 145 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efna3O08545 230 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EllO08856 602 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P18533 117 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsg2P47759 171 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ArntP53762 791 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo40P62932 710 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf14P70379 247 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps5P97461 204 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Perm1Q149B8 807 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde12Q3TIU4 608 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnpy1Q4VAB4 94 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q5SPV6 233 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osgepl1Q6PEB4 414 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmeff1Q6PFE7 372 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q80Y39 304 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pomt2Q8BGQ4 820 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gprin3Q8BWS5 763 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eri3Q8C460 337 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfikkn1Q8R0S6 552 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntng1Q8R4G0 539 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epsti1Q8VDI1 314 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1033Q8VFK5 310 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntn4Q9JI33 628 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phc2Q9QWH1 850 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspb3Q9QZ57 154 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Orc6Q9WUJ8 262 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srd5a3Q9WUP4 330 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem201A2A8U2 664 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif28pD3YXS5 1028 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr288E9Q1P2 318 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3476K7N6V0 257 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r95L7N274 845 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dll3O88516 592 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csf2P01587 141 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pmp22P16646 161 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PlgP20918 812 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxd12P23812 268 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DcnP28654 354 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GalP47212 124 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2e3P52483 207 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgb2lQ3UV74 738 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Macrod2Q3UYG8 475 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CishQ62225 257 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sdc3Q64519 442 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CslQ80X68 466 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtp2Q80ZI2 223 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Katnb1Q8BG40 658 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IlvblQ8BU33 632 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scara5Q8K299 491 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr551Q8VG23 315 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FastkQ9JIX9 511 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uba2Q9Z1F9 638 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ybx2Q9Z2C8 360 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CcniQ9Z2V9 377 aa11.87□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A286YDP4 300 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r9K7N6Z8 848 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rdh5O55240 318 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmco2P0C1V4 183 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PdxpP60487 292 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IgfalsP70389 603 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hif3aQ0VBL6 662 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankdd1bQ14DN9 521 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim45Q6PFY8 580 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb37Q8C3U9 504 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osgin1Q8VC10 478 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr693Q8VF89 316 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1c21Q91WR5 323 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Otud1Q9CUB6 454 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700069L16RikQ9D9H5 109 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata19Q9DAQ9 154 aa11.86□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sphk2Q9JIA7 617 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.9 ms