Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,14■■■■□ 3,38
Thbs4Q9Z1T2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Thbs4Q9Z1T2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,85
Thbs4Q9Z1T2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Thbs4Q9Z1T2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Thbs4Q9Z1T2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,93■■■□□ 2,7
Thbs4Q9Z1T2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Thbs4Q9Z1T2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,37■■■□□ 2,61
Thbs4Q9Z1T2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,22■■■□□ 2,59
Thbs4Q9Z1T2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Thbs4Q9Z1T2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Thbs4Q9Z1T2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Thbs4Q9Z1T2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
Thbs4Q9Z1T2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Thbs4Q9Z1T2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Thbs4Q9Z1T2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Thbs4Q9Z1T2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Thbs4Q9Z1T2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Thbs4Q9Z1T2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Thbs4Q9Z1T2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Thbs4Q9Z1T2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Thbs4Q9Z1T2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Thbs4Q9Z1T2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Thbs4Q9Z1T2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Thbs4Q9Z1T2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Thbs4Q9Z1T2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Thbs4Q9Z1T2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Thbs4Q9Z1T2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Thbs4Q9Z1T2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Thbs4Q9Z1T2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Thbs4Q9Z1T2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Thbs4Q9Z1T2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Thbs4Q9Z1T2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Thbs4Q9Z1T2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Thbs4Q9Z1T2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Thbs4Q9Z1T2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Thbs4Q9Z1T2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Thbs4Q9Z1T2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Thbs4Q9Z1T2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Thbs4Q9Z1T2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Thbs4Q9Z1T2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Thbs4Q9Z1T2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Thbs4Q9Z1T2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Thbs4Q9Z1T2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Thbs4Q9Z1T2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Thbs4Q9Z1T2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Thbs4Q9Z1T2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Thbs4Q9Z1T2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Thbs4Q9Z1T2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Thbs4Q9Z1T2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Thbs4Q9Z1T2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Thbs4Q9Z1T2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Thbs4Q9Z1T2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Thbs4Q9Z1T2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Thbs4Q9Z1T2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Thbs4Q9Z1T2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Thbs4Q9Z1T2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Thbs4Q9Z1T2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Thbs4Q9Z1T2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Thbs4Q9Z1T2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Thbs4Q9Z1T2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Thbs4Q9Z1T2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Thbs4Q9Z1T2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Thbs4Q9Z1T2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Thbs4Q9Z1T2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Thbs4Q9Z1T2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Thbs4Q9Z1T2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Thbs4Q9Z1T2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Thbs4Q9Z1T2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Thbs4Q9Z1T2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Thbs4Q9Z1T2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Thbs4Q9Z1T2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Thbs4Q9Z1T2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Thbs4Q9Z1T2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Thbs4Q9Z1T2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Thbs4Q9Z1T2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Thbs4Q9Z1T2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Thbs4Q9Z1T2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Thbs4Q9Z1T2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Thbs4Q9Z1T2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Thbs4Q9Z1T2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Thbs4Q9Z1T2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Thbs4Q9Z1T2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Thbs4Q9Z1T2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Thbs4Q9Z1T2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Thbs4Q9Z1T2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Thbs4Q9Z1T2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Thbs4Q9Z1T2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Thbs4Q9Z1T2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Thbs4Q9Z1T2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Thbs4Q9Z1T2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Thbs4Q9Z1T2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Thbs4Q9Z1T2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Thbs4Q9Z1T2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Thbs4Q9Z1T2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Thbs4Q9Z1T2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Thbs4Q9Z1T2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms