Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Thbs4Q9Z1T2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Thbs4Q9Z1T2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Thbs4Q9Z1T2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Thbs4Q9Z1T2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Thbs4Q9Z1T2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Thbs4Q9Z1T2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Thbs4Q9Z1T2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Thbs4Q9Z1T2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Thbs4Q9Z1T2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Thbs4Q9Z1T2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Thbs4Q9Z1T2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Thbs4Q9Z1T2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Thbs4Q9Z1T2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Thbs4Q9Z1T2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Thbs4Q9Z1T2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Thbs4Q9Z1T2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thbs4Q9Z1T2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Thbs4Q9Z1T2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Thbs4Q9Z1T2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Thbs4Q9Z1T2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Thbs4Q9Z1T2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Thbs4Q9Z1T2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Thbs4Q9Z1T2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Thbs4Q9Z1T2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Thbs4Q9Z1T2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Thbs4Q9Z1T2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Thbs4Q9Z1T2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Thbs4Q9Z1T2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Thbs4Q9Z1T2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Thbs4Q9Z1T2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Thbs4Q9Z1T2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Thbs4Q9Z1T2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Thbs4Q9Z1T2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Thbs4Q9Z1T2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Thbs4Q9Z1T2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Thbs4Q9Z1T2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Thbs4Q9Z1T2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Thbs4Q9Z1T2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Thbs4Q9Z1T2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thbs4Q9Z1T2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thbs4Q9Z1T2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thbs4Q9Z1T2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Thbs4Q9Z1T2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Thbs4Q9Z1T2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Thbs4Q9Z1T2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Thbs4Q9Z1T2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thbs4Q9Z1T2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thbs4Q9Z1T2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Thbs4Q9Z1T2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Thbs4Q9Z1T2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Thbs4Q9Z1T2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Thbs4Q9Z1T2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thbs4Q9Z1T2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thbs4Q9Z1T2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Thbs4Q9Z1T2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thbs4Q9Z1T2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Thbs4Q9Z1T2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Thbs4Q9Z1T2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Thbs4Q9Z1T2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Thbs4Q9Z1T2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Thbs4Q9Z1T2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Thbs4Q9Z1T2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Thbs4Q9Z1T2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Thbs4Q9Z1T2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Thbs4Q9Z1T2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Thbs4Q9Z1T2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Thbs4Q9Z1T2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Thbs4Q9Z1T2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Thbs4Q9Z1T2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Thbs4Q9Z1T2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Thbs4Q9Z1T2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Thbs4Q9Z1T2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Thbs4Q9Z1T2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Thbs4Q9Z1T2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Thbs4Q9Z1T2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Thbs4Q9Z1T2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Thbs4Q9Z1T2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Thbs4Q9Z1T2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thbs4Q9Z1T2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Thbs4Q9Z1T2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Thbs4Q9Z1T2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Thbs4Q9Z1T2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Thbs4Q9Z1T2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thbs4Q9Z1T2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Thbs4Q9Z1T2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Thbs4Q9Z1T2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Thbs4Q9Z1T2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Thbs4Q9Z1T2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Thbs4Q9Z1T2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Thbs4Q9Z1T2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Thbs4Q9Z1T2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Thbs4Q9Z1T2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms