Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H1

Pphln1, Periphilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pphln1Q8K2H1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pphln1Q8K2H1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Pphln1Q8K2H1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pphln1Q8K2H1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pphln1Q8K2H1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pphln1Q8K2H1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pphln1Q8K2H1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pphln1Q8K2H1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pphln1Q8K2H1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pphln1Q8K2H1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pphln1Q8K2H1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pphln1Q8K2H1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pphln1Q8K2H1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pphln1Q8K2H1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pphln1Q8K2H1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Pphln1Q8K2H1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pphln1Q8K2H1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pphln1Q8K2H1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pphln1Q8K2H1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pphln1Q8K2H1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pphln1Q8K2H1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pphln1Q8K2H1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pphln1Q8K2H1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pphln1Q8K2H1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pphln1Q8K2H1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pphln1Q8K2H1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pphln1Q8K2H1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pphln1Q8K2H1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pphln1Q8K2H1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pphln1Q8K2H1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Pphln1Q8K2H1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pphln1Q8K2H1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pphln1Q8K2H1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pphln1Q8K2H1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pphln1Q8K2H1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pphln1Q8K2H1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pphln1Q8K2H1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pphln1Q8K2H1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pphln1Q8K2H1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pphln1Q8K2H1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pphln1Q8K2H1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pphln1Q8K2H1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pphln1Q8K2H1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pphln1Q8K2H1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pphln1Q8K2H1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pphln1Q8K2H1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pphln1Q8K2H1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pphln1Q8K2H1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pphln1Q8K2H1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pphln1Q8K2H1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pphln1Q8K2H1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pphln1Q8K2H1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pphln1Q8K2H1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pphln1Q8K2H1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pphln1Q8K2H1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pphln1Q8K2H1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pphln1Q8K2H1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pphln1Q8K2H1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pphln1Q8K2H1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pphln1Q8K2H1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pphln1Q8K2H1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pphln1Q8K2H1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pphln1Q8K2H1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pphln1Q8K2H1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pphln1Q8K2H1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pphln1Q8K2H1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pphln1Q8K2H1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pphln1Q8K2H1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pphln1Q8K2H1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pphln1Q8K2H1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pphln1Q8K2H1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pphln1Q8K2H1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pphln1Q8K2H1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pphln1Q8K2H1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pphln1Q8K2H1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pphln1Q8K2H1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pphln1Q8K2H1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pphln1Q8K2H1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pphln1Q8K2H1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pphln1Q8K2H1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pphln1Q8K2H1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pphln1Q8K2H1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pphln1Q8K2H1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pphln1Q8K2H1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pphln1Q8K2H1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pphln1Q8K2H1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pphln1Q8K2H1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pphln1Q8K2H1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pphln1Q8K2H1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pphln1Q8K2H1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pphln1Q8K2H1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pphln1Q8K2H1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pphln1Q8K2H1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pphln1Q8K2H1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pphln1Q8K2H1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pphln1Q8K2H1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pphln1Q8K2H1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pphln1Q8K2H1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pphln1Q8K2H1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pphln1Q8K2H1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms