Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Efna3O08545 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Efna3O08545 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Efna3O08545 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Efna3O08545 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Efna3O08545 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Efna3O08545 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Efna3O08545 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Efna3O08545 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Efna3O08545 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Efna3O08545 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Efna3O08545 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Efna3O08545 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Efna3O08545 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Efna3O08545 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Efna3O08545 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Efna3O08545 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Efna3O08545 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Efna3O08545 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Efna3O08545 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efna3O08545 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efna3O08545 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efna3O08545 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efna3O08545 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Efna3O08545 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Efna3O08545 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Efna3O08545 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efna3O08545 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Efna3O08545 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Efna3O08545 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Efna3O08545 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Efna3O08545 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Efna3O08545 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Efna3O08545 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Efna3O08545 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Efna3O08545 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Efna3O08545 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Efna3O08545 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Efna3O08545 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Efna3O08545 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Efna3O08545 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Efna3O08545 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Efna3O08545 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Efna3O08545 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Efna3O08545 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Efna3O08545 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Efna3O08545 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Efna3O08545 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Efna3O08545 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Efna3O08545 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Efna3O08545 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Efna3O08545 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Efna3O08545 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Efna3O08545 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Efna3O08545 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Efna3O08545 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Efna3O08545 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Efna3O08545 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Efna3O08545 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Efna3O08545 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Efna3O08545 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Efna3O08545 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Efna3O08545 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Efna3O08545 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Efna3O08545 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Efna3O08545 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Efna3O08545 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Efna3O08545 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Efna3O08545 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Efna3O08545 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Efna3O08545 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Efna3O08545 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Efna3O08545 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Efna3O08545 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efna3O08545 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Efna3O08545 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Efna3O08545 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Efna3O08545 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Efna3O08545 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Efna3O08545 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Efna3O08545 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efna3O08545 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efna3O08545 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efna3O08545 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Efna3O08545 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Efna3O08545 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Efna3O08545 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Efna3O08545 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efna3O08545 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Efna3O08545 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efna3O08545 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efna3O08545 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efna3O08545 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efna3O08545 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Efna3O08545 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efna3O08545 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efna3O08545 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efna3O08545 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efna3O08545 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efna3O08545 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms