RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYNCQ9H7C4 482 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DEC1Q9P2X7 70 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NRBP1Q9UHY1 535 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCDHGB4Q9UN71 923 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WDR45Q9Y484 360 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRPV2Q9Y5S1 764 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC88CQ9P219 2028 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRIP11Q15643 1979 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PFASO15067 1338 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 I3L1I5 382 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADAM12O43184 909 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PEX14O75381 377 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CSF2P04141 144 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LINC00869P0C866 280 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAX3P23760 479 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADORA2BP29275 332 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADSSP30520 456 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TGFBR2P37173 567 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ST8SIA6P61647 398 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF154Q13106 437 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALCAMQ13740 583 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RABGAP1LQ5R372 815 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARMC4Q5T2S8 1044 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SAXO2Q658L1 398 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRR5LQ6MZQ0 368 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LCA5Q86VQ0 697 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4F17Q8NGA8 305 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR52J3Q8NH60 311 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPATA18Q8TC71 538 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MCHR2Q969V1 340 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRRC58Q96CX6 371 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBATAQ96M53 351 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4F4Q96R69 305 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NRIP2Q9BQI9 281 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF559Q9BR84 538 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF126Q9BV68 326 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANGPTL4Q9BY76 406 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GHITMQ9H3K2 345 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UNC45AQ9H3U1 944 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNPLA3Q9NST1 481 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PDRG1Q9NUG6 133 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ELOVL2Q9NXB9 296 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPRR3Q9UBC9 169 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBC1D29Q9UFV1 150 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF222Q9UK12 451 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COL4A1P02462 1669 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANKRD12Q6UB98 2062 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYNJ2O15056 1496 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLXNA3P51805 1871 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 METP08581 1390 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CACNA1GO43497 2377 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM86B1E9PN63 330 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CD5LO43866 347 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AKAP3O75969 853 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PGM3O95394 542 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FCER2P06734 321 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM86B2P0C5J1 330 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POLR2MP0CAP2 368 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CGB3P0DN86 165 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PGAM1P18669 254 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SDC1P18827 310 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TCN2P20062 427 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NMUP48645 174 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPIBQ01892 262 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GRB7Q14451 532 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPAT3Q53EU6 434 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM110Q86TL2 294 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF573Q86YE8 665 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCP2Q8IVA1 136 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MFSD6LQ8IWD5 586 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PGAM4Q8N0Y7 254 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAGAPQ8N103 731 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNKDQ8N490 385 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OCC1Q8TAD7 63 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HEXDCQ8WVB3 486 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR1E3Q8WZA6 343 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM159Q96B96 161 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C5orf30Q96GV9 206 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TIMD4Q96H15 378 aa-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms